More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1840 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  100 
 
 
591 aa  1167    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  26.03 
 
 
609 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  29.73 
 
 
613 aa  261  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  28.89 
 
 
592 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  26.77 
 
 
623 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  27.95 
 
 
621 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  24.96 
 
 
604 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.3 
 
 
603 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  24.53 
 
 
621 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  24.35 
 
 
621 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  24.35 
 
 
621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  26.45 
 
 
625 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  26.28 
 
 
625 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  24.96 
 
 
603 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.19 
 
 
566 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.76 
 
 
587 aa  228  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  27.32 
 
 
614 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  32.37 
 
 
613 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  27.09 
 
 
611 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  25.88 
 
 
611 aa  219  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  29.15 
 
 
597 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  23.83 
 
 
625 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  23.98 
 
 
616 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  26.08 
 
 
618 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  27.02 
 
 
605 aa  206  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  28.42 
 
 
606 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  27.2 
 
 
603 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 
626 aa  204  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  27.29 
 
 
603 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.2 
 
 
594 aa  203  8e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  24.75 
 
 
619 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  27.66 
 
 
615 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  25.25 
 
 
616 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  26.2 
 
 
619 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  27.92 
 
 
608 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  25.05 
 
 
626 aa  193  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.55 
 
 
600 aa  192  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  28.04 
 
 
615 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  25.34 
 
 
596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.85 
 
 
633 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  22.68 
 
 
662 aa  190  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  26.55 
 
 
618 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  26.84 
 
 
623 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  25.4 
 
 
619 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  25.75 
 
 
618 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  26.64 
 
 
618 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  29.11 
 
 
593 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  26.85 
 
 
599 aa  181  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  24.67 
 
 
608 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  26.11 
 
 
673 aa  180  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  25.1 
 
 
627 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  40.5 
 
 
975 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  23.98 
 
 
638 aa  179  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  32.97 
 
 
631 aa  178  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.03 
 
 
1000 aa  177  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  25.24 
 
 
546 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  27.19 
 
 
971 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  26.17 
 
 
605 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  25.6 
 
 
578 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  25.98 
 
 
870 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  33.33 
 
 
611 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0117  ABC transporter related  27.27 
 
 
582 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  25.92 
 
 
595 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  26.74 
 
 
626 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.15 
 
 
721 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  24.71 
 
 
647 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  38.37 
 
 
585 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  27.9 
 
 
604 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  25.88 
 
 
584 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  24.95 
 
 
617 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  32.39 
 
 
604 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  25.36 
 
 
633 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  25.63 
 
 
578 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  23.82 
 
 
611 aa  170  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  24.75 
 
 
616 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  25.94 
 
 
593 aa  170  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  27.17 
 
 
598 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.22 
 
 
1018 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  35.38 
 
 
589 aa  169  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  28.63 
 
 
577 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  26 
 
 
550 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.2 
 
 
577 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  25.43 
 
 
1040 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.47 
 
 
596 aa  167  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  27.85 
 
 
1018 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.47 
 
 
596 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.14 
 
 
637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  23.91 
 
 
626 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1188  ABC transporter related  35.81 
 
 
579 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000012355  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  25.24 
 
 
976 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  26.45 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  22.92 
 
 
608 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  25.9 
 
 
556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  30.06 
 
 
592 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  34.47 
 
 
581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  25.2 
 
 
582 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7103  ABC transporter related  34.36 
 
 
585 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  22.97 
 
 
598 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  27.24 
 
 
582 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  24.96 
 
 
586 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>