More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1745 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1745  ABC transporter related  100 
 
 		 538 aa  1045    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000253121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2437  ABC transporter related  28.88 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1182  ABC transporter related  22.68 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.221898  hitchhiker  0.000151899 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  21.3 
 
 		 578 aa  98.2  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  26.47 
 
 		 738 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.61 
 
 		 1013 aa  97.1  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  22.18 
 
 		 581 aa  93.6  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  20.22 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  22.04 
 
 		 582 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  23.19 
 
 		 559 aa  91.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  22.72 
 
 		 714 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  26.07 
 
 		 739 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  22.74 
 
 		 579 aa  90.5  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  22.74 
 
 		 579 aa  90.5  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0894  ABC transporter related  28.81 
 
 		 535 aa  90.5  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  21.72 
 
 		 604 aa  90.1  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0343  ABC transporter related  22.88 
 
 		 544 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  26.45 
 
 		 734 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  22.94 
 
 		 1012 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  22.72 
 
 		 714 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  24.18 
 
 		 747 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.74 
 
 		 727 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  24.73 
 
 		 534 aa  87.8  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  25.07 
 
 		 599 aa  88.2  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  26.36 
 
 		 721 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  22.74 
 
 		 618 aa  87.8  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  26.81 
 
 		 521 aa  87.8  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  24.76 
 
 		 727 aa  87  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  26 
 
 		 578 aa  86.7  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.64 
 
 		 1016 aa  86.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  21.29 
 
 		 986 aa  86.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  21.61 
 
 		 740 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.02 
 
 		 734 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  21.31 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  21.48 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  21.93 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.44 
 
 		 717 aa  84.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.52 
 
 		 1000 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  20.3 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  25.3 
 
 		 591 aa  83.6  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  23.83 
 
 		 870 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  23.33 
 
 		 625 aa  83.2  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  29.21 
 
 		 576 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3626  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.48 
 
 		 549 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202721 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  22.84 
 
 		 566 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  20.04 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3369  ABC transporter, ATP-binding protein and permease  21.52 
 
 		 564 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2980  ABC transporter, transmembrane region  20.78 
 
 		 572 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  24.08 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8821  predicted protein  22.89 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  21.88 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  20.04 
 
 		 619 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  22.97 
 
 		 597 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  25 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  19.78 
 
 		 1218 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  21.65 
 
 		 610 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53150  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  20.22 
 
 		 596 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  23.29 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  22.97 
 
 		 597 aa  82  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  25.33 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  19.82 
 
 		 1218 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3407  ABC transporter ATP-binding/permease  21.78 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1348  Type I secretion system ATPase, PrtD  22.87 
 
 		 556 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.716552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  24.33 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  24 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3676  ABC transporter permease/ATP-binding protein  21.78 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  22.94 
 
 		 588 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  21.68 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2087  ABC transporter related  22.57 
 
 		 579 aa  80.5  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  24.08 
 
 		 722 aa  80.5  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  22.49 
 
 		 580 aa  80.1  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  21.27 
 
 		 721 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1685  ABC transporter related protein  23.97 
 
 		 574 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  25.9 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3048  ABC transporter related  24 
 
 		 740 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  25.84 
 
 		 716 aa  79.7  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  23.02 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  25.5 
 
 		 920 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  22.1 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  23.52 
 
 		 980 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.02 
 
 		 1006 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  22.87 
 
 		 571 aa  79  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  22.51 
 
 		 731 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  20.89 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  20 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.98 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.76 
 
 		 1024 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  26.04 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0957  hypothetical protein  20.86 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  21.79 
 
 		 571 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  21.79 
 
 		 571 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  24.94 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.79 
 
 		 571 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  26.29 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  22.1 
 
 		 590 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  22.17 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  21.79 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  23.9 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  21.79 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  28.37 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>