More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1664 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
633 aa  637    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
638 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
636 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  53.62 
 
 
586 aa  645    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
635 aa  746    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
640 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
636 aa  682    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
634 aa  742    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
640 aa  687    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 
635 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 
637 aa  722    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
639 aa  688    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
639 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
639 aa  726    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
639 aa  692    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
636 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
640 aa  1320    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 
634 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
639 aa  693    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
638 aa  666    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
634 aa  644    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
640 aa  676    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
635 aa  714    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
645 aa  654    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
642 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
639 aa  688    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  52.92 
 
 
586 aa  639    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
631 aa  660    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000476694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 
640 aa  664    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
584 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
633 aa  754    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
640 aa  666    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  55.36 
 
 
636 aa  724    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
640 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
640 aa  673    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
643 aa  653    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000177582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
645 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
637 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 
635 aa  731    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
639 aa  677    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
636 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
636 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
635 aa  738    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
639 aa  685    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
638 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
588 aa  632  1e-180  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
638 aa  634  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
638 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  54 
 
 
586 aa  633  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
644 aa  627  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
641 aa  626  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
638 aa  622  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
635 aa  624  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
640 aa  624  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
640 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
636 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2148  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
642 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00500642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2330  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
642 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0271546  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2222  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
642 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000682535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1705  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
642 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0371819  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
640 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
644 aa  617  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
642 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02485  threonyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
638 aa  615  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0163148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2805  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
633 aa  618  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2184  threonyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
642 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00110297  normal  0.0619303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2299  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
642 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
644 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
641 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2018  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
642 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000164437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01383  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
649 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
646 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
662 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
635 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1955  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
642 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000861339  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2021  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
642 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0151437  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
643 aa  615  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2053  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
642 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.22159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
635 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2043  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
642 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000275607  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1951  threonyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
642 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
642 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1913  threonyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
642 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.121147  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
635 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1472  threonyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
642 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000205456  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
635 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
635 aa  611  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
641 aa  609  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2263  threonyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
642 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01677  hypothetical protein  46.65 
 
 
642 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0538316  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
640 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>