More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1662 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  100 
 
 
453 aa  898    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  45.49 
 
 
456 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  43.12 
 
 
461 aa  360  4e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  31.92 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  30.75 
 
 
477 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  30.51 
 
 
455 aa  203  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  32.46 
 
 
447 aa  192  7e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  32.24 
 
 
447 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  32.89 
 
 
449 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  31.28 
 
 
455 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
460 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  31.28 
 
 
455 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  31.17 
 
 
447 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.35 
 
 
460 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.39 
 
 
456 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
458 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  30.88 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  28.15 
 
 
458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.67 
 
 
454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  28.76 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.89 
 
 
448 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  27.54 
 
 
456 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.18 
 
 
460 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
453 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
468 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.7 
 
 
460 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
460 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.84 
 
 
454 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  26.27 
 
 
484 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  29.3 
 
 
462 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.97 
 
 
454 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  29.57 
 
 
451 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  29.57 
 
 
451 aa  154  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  29.74 
 
 
455 aa  153  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  29.5 
 
 
460 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  28.9 
 
 
454 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  25.28 
 
 
463 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  28.13 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  24.6 
 
 
485 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  27.54 
 
 
455 aa  146  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  28.7 
 
 
554 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.42 
 
 
478 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  28.12 
 
 
485 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.99 
 
 
538 aa  144  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
437 aa  144  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
442 aa  143  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
451 aa  143  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
455 aa  142  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.74 
 
 
472 aa  142  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.64 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.86 
 
 
457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  30.68 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.9 
 
 
466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  27.65 
 
 
462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  28.03 
 
 
449 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
500 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.94 
 
 
481 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
467 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1820  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  25.71 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  26.27 
 
 
454 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  26.92 
 
 
448 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.36 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  26.72 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.2 
 
 
448 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.52 
 
 
448 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
455 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  29.26 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25.93 
 
 
455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  25.72 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  28.83 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
448 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
443 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  27.49 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  28.4 
 
 
454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  26.15 
 
 
454 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  25.58 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.58 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  25.53 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  23.87 
 
 
499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  28.15 
 
 
453 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
451 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  25.39 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  26.7 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>