More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1646 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1018    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
486 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
491 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
482 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
500 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
485 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
481 aa  414  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
503 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
485 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
494 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
491 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
502 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
504 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
502 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
491 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
488 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
502 aa  398  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
484 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
488 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
492 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
484 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
484 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
485 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
485 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
484 aa  387  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
485 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
503 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
490 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
490 aa  379  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
502 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
488 aa  377  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
490 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
487 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
506 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
480 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
507 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
484 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
479 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
506 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
499 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
489 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
504 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
477 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
485 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
494 aa  358  9e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
491 aa  356  6.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
509 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
478 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
483 aa  355  1e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
516 aa  354  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
500 aa  353  4e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
495 aa  353  5.9999999999999994e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
484 aa  352  7e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
464 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
493 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
501 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
481 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
484 aa  351  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
466 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
469 aa  347  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
476 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
484 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
489 aa  345  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
464 aa  344  2e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
494 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
493 aa  342  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
493 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
493 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
493 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
465 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
509 aa  341  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
479 aa  341  2e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
464 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
464 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
488 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
501 aa  340  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
535 aa  340  5e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
482 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
514 aa  339  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
467 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
493 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>