More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1645 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 472 aa  961    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 465 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 465 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 465 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  52.98 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 465 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0117  cysteinyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  52.64 
 
 		 465 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0207  cysteinyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 472 aa  488  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0552  cysteinyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0171  cysteinyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000554263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0170  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.183538  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 448 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 474 aa  448  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0162  cysteinyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1559  cysteinyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 		 467 aa  438  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 493 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 481 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 478 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 478 aa  428  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 481 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 486 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 469 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  43.99 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 487 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 477 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 479 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 489 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0635  cysteinyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3792  cysteinyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158912  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1390  cysteinyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128529  normal  0.023176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0679  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 474 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>