57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1643 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1643  protein of unknown function DUF901  100 
 
 
177 aa  356  8e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000139339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  32.77 
 
 
888 aa  95.5  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5213  hypothetical protein  34.34 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800561  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0093  protein of unknown function DUF901  35.76 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0089  protein of unknown function DUF901  37.72 
 
 
170 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0113  hypothetical protein  34.34 
 
 
170 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000139976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  33.8 
 
 
880 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0092  hypothetical protein  37.41 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000150806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0123  hypothetical protein  37.41 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000156564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0088  hypothetical protein  37.41 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00128931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0089  hypothetical protein  37.41 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0092  hypothetical protein  37.41 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0113627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0103  hypothetical protein  37.41 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.28353e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0092  hypothetical protein  37.41 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000731503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0849  hypothetical protein  37.9 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0087  hypothetical protein  37.32 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00076755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  33.58 
 
 
885 aa  87.4  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0087  hypothetical protein  36.17 
 
 
170 aa  85.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000109377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0406  protein of unknown function DUF901  43.55 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000350703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  29.93 
 
 
882 aa  85.1  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0173  hypothetical protein  31.95 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.236858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0268  protein of unknown function DUF901  30.81 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000073026  normal  0.0102787 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0569  hypothetical protein  35.88 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.330291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0555  hypothetical protein  35.88 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.110382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0197  hypothetical protein  30.43 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000225035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2712  protein of unknown function DUF901  36.42 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.191969  hitchhiker  0.000000212739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2042  protein of unknown function DUF901  39.34 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000499907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2480  hypothetical protein  31.21 
 
 
166 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091226  hitchhiker  0.00317496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0175  protein of unknown function DUF901  32.87 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640725  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0210  hypothetical protein  29.48 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2419  hypothetical protein  32.43 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0021218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2733  hypothetical protein  32.43 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0191  hypothetical protein  39.34 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0177603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2903  protein of unknown function DUF901  31.61 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3193  protein of unknown function DUF901  31.61 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.747154  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2977  protein of unknown function DUF901  33.11 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2515  hypothetical protein  34.25 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000246969  normal  0.112368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2729  protein of unknown function DUF901  30.41 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3775  hypothetical protein  32.56 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000635481  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36358  predicted protein  30.71 
 
 
354 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0123  RNA-binding protein  30.23 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1227  hypothetical protein  31.37 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453712  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1640  hypothetical protein  31.28 
 
 
177 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.676471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2171  hypothetical protein  29.51 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00990359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19430  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain  32.37 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000111934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3069  protein of unknown function DUF901  32.35 
 
 
484 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0224982  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1633  hypothetical protein  28.33 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0638355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3285  hypothetical protein  26.23 
 
 
519 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2397  protein of unknown function DUF901  32.35 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.495635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3517  hypothetical protein  26.23 
 
 
518 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  29.66 
 
 
471 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2684  hypothetical protein  29.77 
 
 
440 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196033  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1379  protein of unknown function DUF901  28.35 
 
 
517 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0052  hypothetical protein  25.17 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3126  hypothetical protein  27.87 
 
 
425 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03800  predicted RNA-binding protein containing a PIN domain protein  27.48 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000618341  normal  0.163612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1302  hypothetical protein  28.21 
 
 
437 aa  40.8  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>