More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1575 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  100 
 
 
102 aa  204  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000000735097  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 
102 aa  167  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 
102 aa  167  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  80.39 
 
 
102 aa  167  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3924  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  77.67 
 
 
103 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  75.49 
 
 
102 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  75.73 
 
 
103 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  158  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  157  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  157  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 
102 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  73.53 
 
 
102 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000877818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  74.51 
 
 
102 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  154  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  72.55 
 
 
102 aa  154  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3668  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 
105 aa  154  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  153  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  153  9e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  153  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  153  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  153  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 
102 aa  150  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  150  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  150  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  68.93 
 
 
103 aa  150  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  71.57 
 
 
102 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  148  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
102 aa  148  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  70 
 
 
103 aa  147  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  70.59 
 
 
102 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  69.61 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  68.63 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  67.65 
 
 
102 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  67.65 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0697  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  67.65 
 
 
102 aa  144  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  144  5e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  67.65 
 
 
102 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl122  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  143  6e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  5.36997e-55  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  66.67 
 
 
102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  68.63 
 
 
102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1139  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
102 aa  142  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000305109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  142  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3025  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.544765  hitchhiker  0.00279122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
102 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 
102 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  66.34 
 
 
101 aa  141  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  141  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  65.69 
 
 
102 aa  141  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3759  ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  140  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1122  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  140  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  140  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6615  30S ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  140  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
106 aa  140  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3436  ribosomal protein S10  65.35 
 
 
101 aa  140  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  141  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  64.65 
 
 
101 aa  140  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0755  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
103 aa  140  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000508535  normal  0.0162488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0952  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000292109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1186  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.376062  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4508  ribosomal protein S10  63.37 
 
 
101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.815174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0714  ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1868  30S ribosomal protein S10  62.38 
 
 
107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0207865  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  64.36 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0326  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0169409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0496  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.250229  hitchhiker  0.00000000405496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  64 
 
 
101 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>