More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1574 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1574  ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  420  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299368  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 209 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  52.09 
 
 		 220 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  52.56 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 213 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  51.63 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 207 aa  197  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 212 aa  198  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  48.24 
 
 		 209 aa  197  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  50 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 211 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  51 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 205 aa  187  9e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  45.85 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  46.86 
 
 		 226 aa  184  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 214 aa  184  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  45.32 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.45 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  49.52 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0328  ribosomal protein L3  42.11 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  44.02 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  45.81 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3636  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  48.57 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  44.61 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  47.8 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3744  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00311101  normal  0.0177476 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>