More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1568 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  67.61 
 
 		 226 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  64.06 
 
 		 222 aa  298  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  66.82 
 
 		 218 aa  297  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  61.57 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  65.71 
 
 		 220 aa  291  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  63.81 
 
 		 221 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  64.06 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  63.59 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  64.32 
 
 		 217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  61.93 
 
 		 226 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  62.21 
 
 		 219 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  61.5 
 
 		 219 aa  278  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  61.75 
 
 		 219 aa  278  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  64.76 
 
 		 214 aa  278  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  61.29 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  62.91 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  61.4 
 
 		 221 aa  275  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  62.44 
 
 		 221 aa  275  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  62.86 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  62.86 
 
 		 217 aa  274  8e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 217 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  59.07 
 
 		 220 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  60.75 
 
 		 217 aa  271  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  60.37 
 
 		 219 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  58.69 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  58.57 
 
 		 229 aa  257  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  57.53 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  57.53 
 
 		 224 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 211 aa  257  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  59.91 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  58.96 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  57.27 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  57.08 
 
 		 224 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  57.08 
 
 		 224 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 211 aa  254  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  58.96 
 
 		 210 aa  254  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  54.67 
 
 		 216 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 222 aa  252  3e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  55.51 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  53.36 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  56.5 
 
 		 227 aa  249  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  51.46 
 
 		 241 aa  248  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  50.62 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  53.45 
 
 		 233 aa  246  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  53.45 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  53.45 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  52.52 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  55.98 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  49.59 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  51.26 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2075  30S ribosomal protein S3  52.59 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000597186  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  51.93 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  52.53 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  53.81 
 
 		 395 aa  238  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 249 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0040  30S ribosomal protein S3  53.25 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0666312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  54.67 
 
 		 237 aa  237  9e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  50.86 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 223 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  53.21 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 278 aa  236  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  50.86 
 
 		 232 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  54.29 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  51.93 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  50.88 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  52.19 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>