More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1557 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  100 
 
 		 169 aa  337  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 165 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  62.58 
 
 		 165 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  67.09 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 166 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  63.41 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  64.81 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  63.58 
 
 		 166 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  66.88 
 
 		 167 aa  207  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  64.02 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  62.8 
 
 		 166 aa  204  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 		 168 aa  203  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  62.2 
 
 		 166 aa  200  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  60.61 
 
 		 167 aa  200  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  63.69 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  61.35 
 
 		 164 aa  195  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  59.76 
 
 		 166 aa  193  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  63.4 
 
 		 167 aa  187  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  58.6 
 
 		 169 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  57.32 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  60.39 
 
 		 165 aa  184  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  59.49 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  56.69 
 
 		 168 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  62 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  61.33 
 
 		 166 aa  178  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  54.43 
 
 		 163 aa  175  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.06 
 
 		 163 aa  175  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  56.52 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000874802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  53.09 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 		 162 aa  174  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  55.7 
 
 		 206 aa  173  9e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  55.19 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  53.09 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  52.44 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  54.43 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 202 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  56.05 
 
 		 202 aa  170  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  58.71 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000316  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  50.3 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  55 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  58.94 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  56.95 
 
 		 205 aa  168  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 210 aa  167  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  56.69 
 
 		 199 aa  167  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  54.55 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  53.75 
 
 		 236 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  57.89 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  53.9 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  53.25 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2384  30S ribosomal protein S5  58.64 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0029509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  56.95 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  54.78 
 
 		 238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  51.27 
 
 		 163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  54.97 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  56.95 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  55.48 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0075  30S ribosomal protein S5  62.18 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.774512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  51.9 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0271  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228264  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1837  30S ribosomal protein S5  51.95 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.470796  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0243  30S ribosomal protein S5  50.61 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0354  30S ribosomal protein S5  51.95 
 
 		 168 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  54.61 
 
 		 162 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  55.63 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1890  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  53.21 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  53.85 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  50.94 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3897  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0600  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155795  normal  0.912114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0300  30S ribosomal protein S5  52.15 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000391785  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0302  30S ribosomal protein S5  52.83 
 
 		 191 aa  160  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0307  30S ribosomal protein S5  53.99 
 
 		 174 aa  160  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3619  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4527  30S ribosomal protein S5  53.25 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000233492  hitchhiker  0.000167424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  52.6 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>