263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1556 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1556  ribosomal protein L30  100 
 
 		 60 aa  120  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000500993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  60.34 
 
 		 62 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  64.29 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  56.9 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  62.5 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  62.5 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0212  LSU ribosomal protein L30P  56.9 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161029  normal  0.28126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2696  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2381  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 59 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1725  50S ribosomal protein L30  50.82 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000657277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  57.63 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  52.54 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1849  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.935152 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  50 
 
 		 58 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  51.67 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  50.85 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04160  LSU ribosomal protein L30P  44.07 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  46.67 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  44.07 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  44.64 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  43.33 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  46.43 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0612  50S ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0237089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2921  50S ribosomal protein L30  47.46 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000749762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3887  50S ribosomal protein L30  43.33 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  49.06 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>