More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1550 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  100 
 
 		 114 aa  225  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  69.37 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  69.03 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  67.54 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  67.86 
 
 		 123 aa  159  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  68.14 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  66.07 
 
 		 122 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  65.49 
 
 		 121 aa  157  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  65.49 
 
 		 121 aa  156  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  65.49 
 
 		 121 aa  156  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  65.49 
 
 		 121 aa  156  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  65.49 
 
 		 121 aa  156  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  65.49 
 
 		 121 aa  156  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  65.49 
 
 		 121 aa  156  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  64.6 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  64.6 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  64.6 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  65.79 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  66.07 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  67.57 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  67.57 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  67.57 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  66.07 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  65.77 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  65.77 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  63.72 
 
 		 121 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  66.07 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  64.86 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  65.77 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  64.04 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  65.77 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  61.61 
 
 		 123 aa  149  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  62.16 
 
 		 121 aa  149  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  65.18 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  61.95 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  63.06 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  63.39 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  60.53 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  56.64 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  62.28 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  61.61 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  58.26 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 122 aa  144  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  60.36 
 
 		 118 aa  144  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  59.82 
 
 		 121 aa  143  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0618  30S ribosomal protein S13  61.95 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0506  30S ribosomal protein S13  60.36 
 
 		 118 aa  143  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00117339  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  60.71 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  61.61 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  57.89 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  61.61 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  61.61 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  59.65 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 122 aa  141  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  57.89 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  62.28 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 122 aa  141  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  59.65 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  57.89 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  54.87 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  58.41 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  58.93 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  58.56 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  58.93 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  59.65 
 
 		 125 aa  139  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  58.93 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  60.71 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  59.82 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  61.4 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  55.75 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  59.82 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  60.71 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  58.93 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3420  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 121 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610551  normal  0.118326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  62.28 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  60.18 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  56.64 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 122 aa  137  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  59.82 
 
 		 122 aa  137  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  54.39 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>