More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1500 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.35 
 
 
542 aa  670    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0680  chaperonin GroEL  63.02 
 
 
549 aa  653    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.156157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
544 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1034  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
545 aa  640    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.226771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0498  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
547 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000658221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1175  chaperonin GroEL  57.98 
 
 
544 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.462381  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1484  chaperonin GroEL  64.57 
 
 
539 aa  693    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0241945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  61.61 
 
 
548 aa  663    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  61.19 
 
 
545 aa  636    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  65.12 
 
 
540 aa  701    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3289  chaperonin GroEL  67.62 
 
 
541 aa  711    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00111576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
544 aa  688    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
544 aa  691    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
544 aa  691    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  60.59 
 
 
536 aa  651    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  66.23 
 
 
544 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  64.44 
 
 
538 aa  691    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  64.44 
 
 
538 aa  687    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3659  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
540 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  62.69 
 
 
540 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60.37 
 
 
547 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0834  chaperonin GroEL  62 
 
 
547 aa  639    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000396118  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2189  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
546 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  61.45 
 
 
539 aa  662    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  60 
 
 
546 aa  636    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2103  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
538 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.144085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
544 aa  688    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  61.01 
 
 
541 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  100 
 
 
540 aa  1062    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60 
 
 
549 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  61.05 
 
 
548 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.99 
 
 
539 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.98 
 
 
536 aa  665    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  64.49 
 
 
547 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
538 aa  666    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  59.51 
 
 
540 aa  636    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  61.45 
 
 
540 aa  644    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
546 aa  635    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  61.19 
 
 
545 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000331966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
550 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000375112  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
540 aa  647    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
543 aa  642    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000440547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  69.13 
 
 
547 aa  712    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  60.67 
 
 
550 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
543 aa  644    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  60.84 
 
 
547 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  66.79 
 
 
539 aa  713    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  60.44 
 
 
545 aa  640    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.53 
 
 
547 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1543  chaperonin GroEL  62.08 
 
 
538 aa  662    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  65.5 
 
 
539 aa  689    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  60.64 
 
 
540 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
544 aa  691    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  59.18 
 
 
542 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0317  chaperonin GroEL  63.14 
 
 
544 aa  661    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000185818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  64.26 
 
 
539 aa  687    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  64.26 
 
 
539 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05490  chaperonin GroL  61.55 
 
 
543 aa  649    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2820  chaperonin GroEL  60.94 
 
 
545 aa  646    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000232523  normal  0.159069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
540 aa  639    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1842  chaperonin GroEL  62.95 
 
 
543 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.399369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  58.96 
 
 
542 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  62.24 
 
 
546 aa  667    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  58.89 
 
 
545 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
544 aa  693    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  65.22 
 
 
544 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0440  chaperonin GroEL  64.18 
 
 
542 aa  672    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0734172  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  64.44 
 
 
541 aa  709    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0409  chaperonin GroEL  65.06 
 
 
543 aa  692    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0866481  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  64.63 
 
 
539 aa  696    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0253  chaperonin GroEL  65.49 
 
 
539 aa  698    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.893796  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0354  chaperonin GroEL  63.35 
 
 
542 aa  670    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178362  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1158  chaperonin GroEL  61 
 
 
540 aa  651    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  62.6 
 
 
539 aa  654    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
546 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  68.35 
 
 
543 aa  720    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
544 aa  691    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.19 
 
 
547 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  61.45 
 
 
541 aa  644    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0840  chaperonin GroEL  60.98 
 
 
533 aa  643    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  63.64 
 
 
538 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
542 aa  691    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00670  chaperonin GroEL  62.26 
 
 
544 aa  645    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  67.16 
 
 
541 aa  714    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  61.19 
 
 
545 aa  636    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  62.06 
 
 
538 aa  666    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
544 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  68.44 
 
 
541 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  61.01 
 
 
538 aa  634  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  61.67 
 
 
547 aa  632  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  60.72 
 
 
545 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
543 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0541  chaperonin GroEL  59.7 
 
 
549 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
547 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1211  chaperonin GroEL  58.7 
 
 
543 aa  632  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
540 aa  631  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  60 
 
 
540 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4131  chaperonin GroEL  59.07 
 
 
544 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0472003  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
547 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  59.74 
 
 
551 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>