35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1456 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  100 
 
 
143 aa  290  7e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  53.24 
 
 
140 aa  157  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  55 
 
 
140 aa  153  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  49.65 
 
 
145 aa  150  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  56.1 
 
 
138 aa  144  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000166054  hitchhiker  0.0000000116107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0741  flavodoxin  49.3 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.52675e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  43.17 
 
 
143 aa  136  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0964  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.64 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0186557  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0356  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.61 
 
 
143 aa  124  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000140053  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0878  flavodoxin  41.73 
 
 
141 aa  121  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000147271  hitchhiker  0.000000000457533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0625  flavodoxin  38.85 
 
 
138 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000760525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0611  flavodoxin  38.13 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000166684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2319  flavodoxin  31.69 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2033  flavodoxin  31.69 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  35.71 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.75 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  30.34 
 
 
395 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  32.06 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  29.66 
 
 
396 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  30.28 
 
 
403 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.67 
 
 
423 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  41.67 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  27.78 
 
 
396 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  40 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  28.47 
 
 
404 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.33 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2071  flavodoxin  24.48 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.785736  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3607  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  29.01 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  28.57 
 
 
148 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1205  flavodoxin family protein  36.84 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.95 
 
 
190 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.11 
 
 
191 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  30 
 
 
190 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2648  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.22 
 
 
144 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000348313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>