More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1397 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
265 aa  533  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  55.21 
 
 
260 aa  295  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0131  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  58.2 
 
 
269 aa  275  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.752831  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  54.44 
 
 
264 aa  273  2e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  53.99 
 
 
263 aa  265  7e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  55.94 
 
 
264 aa  260  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
270 aa  254  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 
267 aa  254  1e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 
262 aa  253  2e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  51.35 
 
 
272 aa  253  2e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 
267 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  51.14 
 
 
266 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  52.94 
 
 
264 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
270 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  52.55 
 
 
264 aa  242  4e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
270 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
270 aa  239  3e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
270 aa  238  7e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  48.13 
 
 
271 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  53.88 
 
 
271 aa  235  5e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  52.53 
 
 
260 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 
268 aa  234  1e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
266 aa  234  1e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
284 aa  234  2e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
264 aa  233  2e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 
272 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
269 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
257 aa  229  3e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  46.12 
 
 
270 aa  229  3e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 
288 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
490 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  49.21 
 
 
269 aa  226  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  48.65 
 
 
268 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.12 
 
 
268 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 
268 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
279 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 
270 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
497 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.02 
 
 
264 aa  222  5e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.31 
 
 
270 aa  221  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
277 aa  221  7e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
268 aa  221  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.54 
 
 
273 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
288 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 
288 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
266 aa  221  1e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  50.19 
 
 
269 aa  219  2e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
270 aa  220  2e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 
285 aa  220  2e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
271 aa  220  2e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
270 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
270 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
270 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 
270 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
270 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.10773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
270 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 
265 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  44.12 
 
 
518 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
270 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
260 aa  216  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  45.49 
 
 
285 aa  216  3e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  47.66 
 
 
268 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 
273 aa  214  1e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 
267 aa  214  1e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 
269 aa  213  2e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
280 aa  213  3e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 
283 aa  211  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  47.41 
 
 
263 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
286 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 
270 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
497 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  46.69 
 
 
283 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  48.08 
 
 
295 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 
484 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
267 aa  208  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  43.36 
 
 
266 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
276 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  41.13 
 
 
276 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  44.11 
 
 
297 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
282 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  43.19 
 
 
267 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
267 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
269 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 
285 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
266 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 
264 aa  205  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
266 aa  205  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
266 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 
266 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  204  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  204  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  204  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  204  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  204  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  204  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  48.45 
 
 
273 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.97 
 
 
266 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  47.47 
 
 
269 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
269 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  45.85 
 
 
269 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>