More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1394 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  100 
 
 
129 aa  264  4e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  63.11 
 
 
131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  62.3 
 
 
130 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  62.3 
 
 
130 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  62.6 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  62.3 
 
 
130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  62.6 
 
 
131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  160  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  159  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  159  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  61.48 
 
 
130 aa  159  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 
130 aa  157  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  60.16 
 
 
130 aa  156  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  63.11 
 
 
130 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  153  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  153  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
130 aa  153  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 
130 aa  153  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  62.3 
 
 
130 aa  153  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  152  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  54.2 
 
 
131 aa  152  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  149  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 
131 aa  148  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  147  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 
130 aa  146  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  56.56 
 
 
132 aa  144  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 
130 aa  144  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  58.33 
 
 
132 aa  144  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 
130 aa  144  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  58.2 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  55.81 
 
 
129 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 
130 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  55.81 
 
 
129 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 
128 aa  141  3e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  54.92 
 
 
130 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2563  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714908  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3766  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658387  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0197  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0680  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2703  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  137  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490029  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  54.92 
 
 
133 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  56.1 
 
 
131 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  51.56 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  54.1 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0600  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000648007  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1234  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0574  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  136  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  54.1 
 
 
133 aa  137  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0608  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451686  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
171 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3353  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507288  hitchhiker  0.0000404008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  135  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  135  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  53.08 
 
 
130 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  136  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>