202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1343 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  54.1 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  55 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  53.33 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2502  ribosomal protein L35  53.57 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  52.46 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1556  ribosomal protein L35  54.39 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.637628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  51.67 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2607  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3499  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145508  normal  0.184731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  51.67 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4254  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1408  50S ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.62666e-18  unclonable  7.5203e-29 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1383  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000504728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  45 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  49.15 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  47.54 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  44.26 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  47.54 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  48.33 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0223  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000237579  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  40.98 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2032  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000178716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0170  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00827937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2171  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000338785  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1088  50S ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000177578  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  46.67 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  41.67 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>