16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1308 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1308  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  714    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1224  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 
380 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0562  hypothetical protein  26.73 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0638  multidrug ABC transporter permease  24.88 
 
 
412 aa  115  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.490558  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0695  hypothetical protein  25.71 
 
 
351 aa  97.1  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10720  hypothetical protein  22.54 
 
 
384 aa  86.7  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1805  ABC transporter, permease protein  21.92 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1659  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0599997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1866  ABC transporter, permease protein  21.92 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3535  ABC transporter, permease protein  21.92 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1640  multidrug ABC transporter, permease  20.82 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000347744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1609  multidrug ABC transporter, permease  21.04 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1916  ABC transporter, permease protein  21.92 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1662  ABC transporter permease  20.55 
 
 
369 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1794  ABC transporter permease  20.55 
 
 
369 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>