15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1307 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1307  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 371 aa  728    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1223  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 		 386 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0696  hypothetical protein  26.03 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10730  ABC-2 type transporter  19.77 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0561  hypothetical protein  20.94 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  27.14 
 
 		 906 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.43 
 
 		 906 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  26.43 
 
 		 906 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  20.57 
 
 		 943 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  22.01 
 
 		 914 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  25.71 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  23.28 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3012  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 		 245 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  22.25 
 
 		 915 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  25.34 
 
 		 906 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>