More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1303 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  65.43 
 
 		 81 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  65 
 
 		 90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  65 
 
 		 90 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 		 81 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  65 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  65 
 
 		 81 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  62.96 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  70.67 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  70.67 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  60.76 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  63.51 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  62.67 
 
 		 81 aa  104  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  56.79 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  58.75 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  60.81 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  55.41 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  55 
 
 		 82 aa  100  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  100  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 201 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  57.33 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 183 aa  93.2  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  57.33 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  56 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  52 
 
 		 81 aa  91.3  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  56 
 
 		 159 aa  90.9  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 120 aa  90.1  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  54.67 
 
 		 178 aa  89.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 188 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 192 aa  88.6  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  54.67 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  55.26 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 195 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  53.42 
 
 		 80 aa  87.8  5e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2483  ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 86 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 153 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 197 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  52 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  44.87 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>