244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1245 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1245  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
434 aa  864    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000515099  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1246  sodium:neurotransmitter symporter  61.77 
 
 
430 aa  528  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000125308  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0368  sodium-dependent tyrosine transporter  58.94 
 
 
438 aa  511  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1706  sodium/neurotransmitter symporter family protein  57.01 
 
 
437 aa  488  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0645  sodium-dependent tyrosine transporter  56.8 
 
 
437 aa  484  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1758  sodium:neurotransmitter symporter  45.71 
 
 
448 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0250  sodium-dependent transporter, putative  41.2 
 
 
441 aa  328  8e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.024876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  38.11 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16470  SNF family Na+-dependent transporter  37.07 
 
 
447 aa  266  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1621  sodium:neurotransmitter symporter family protein  37.41 
 
 
437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2211  sodium:neurotransmitter symporter  36.18 
 
 
435 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13520  SNF family Na+-dependent transporter  37.07 
 
 
464 aa  247  3e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1391  sodium:neurotransmitter symporter  33.1 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00760629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  34.01 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  28.64 
 
 
476 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  30.25 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  32.28 
 
 
447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  31.53 
 
 
445 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  30.48 
 
 
450 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  31.31 
 
 
445 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  31.36 
 
 
456 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  31.31 
 
 
445 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  30 
 
 
446 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  31.08 
 
 
445 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  31.31 
 
 
445 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  30.86 
 
 
445 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  29.78 
 
 
446 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  30.86 
 
 
445 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  32.58 
 
 
446 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  30.86 
 
 
445 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.02 
 
 
446 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  31.74 
 
 
446 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  27.46 
 
 
458 aa  157  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  29.42 
 
 
446 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  29.2 
 
 
446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  28.98 
 
 
446 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  30.58 
 
 
445 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  31.18 
 
 
446 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  27.77 
 
 
468 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  31.09 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  31.09 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  28.74 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  31.46 
 
 
452 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  28.28 
 
 
454 aa  153  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  30.72 
 
 
447 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0461  sodium:neurotransmitter symporter  30.88 
 
 
462 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183421  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  28.41 
 
 
470 aa  150  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1199  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  29.72 
 
 
445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.503617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  31.73 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  29.49 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  29.49 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  29.97 
 
 
443 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  31.74 
 
 
475 aa  147  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  28.54 
 
 
473 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  28.35 
 
 
450 aa  146  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  28.49 
 
 
459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  30.51 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  27.53 
 
 
446 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  27.42 
 
 
450 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  33.61 
 
 
447 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  29.08 
 
 
453 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  28.97 
 
 
452 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  26.21 
 
 
454 aa  144  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  28.97 
 
 
452 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  28.97 
 
 
451 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  26.39 
 
 
486 aa  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  28.97 
 
 
452 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  29.11 
 
 
452 aa  143  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  27.76 
 
 
484 aa  143  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  29.23 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  26.94 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  26.82 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  28.97 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  26.58 
 
 
486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1198  sodium- and chloride-dependent transporter, SNF family  29.42 
 
 
444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.413199  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  28.84 
 
 
447 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  28.57 
 
 
447 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  28.7 
 
 
468 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  27.81 
 
 
454 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  28.84 
 
 
447 aa  141  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  32.02 
 
 
473 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  28.04 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  31.01 
 
 
452 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  29.31 
 
 
449 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  29.15 
 
 
444 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  29.15 
 
 
444 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  27.49 
 
 
456 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0854  sodium:neurotransmitter symporter  29.75 
 
 
461 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226539  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  26.97 
 
 
450 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  27.96 
 
 
454 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  30.08 
 
 
458 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  29.49 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  27.25 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  29.15 
 
 
444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  27.91 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  29.49 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  26.35 
 
 
470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  28.7 
 
 
457 aa  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0801  sodium:neurotransmitter symporter  29.82 
 
 
461 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  27.11 
 
 
461 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>