118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1196 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
197 aa  387  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  39.57 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  34.81 
 
 
227 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  38.1 
 
 
203 aa  117  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  34.46 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  30.29 
 
 
236 aa  91.3  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  30.61 
 
 
234 aa  89.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  35.04 
 
 
267 aa  89.4  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  31.29 
 
 
224 aa  82  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  26.83 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  34.82 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  28.36 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  28.36 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  27.27 
 
 
623 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  28.95 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.528389 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  28.85 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.85 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  28.85 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  28.85 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  28.85 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  28.85 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  28.85 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  29.66 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  33.85 
 
 
234 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  29.66 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  32.26 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  32.26 
 
 
231 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  27.21 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  29.19 
 
 
252 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  26.34 
 
 
231 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  26.53 
 
 
320 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  29.55 
 
 
222 aa  58.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  58.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  25.97 
 
 
238 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  25.52 
 
 
272 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  33.33 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20181  hypothetical protein  25.93 
 
 
214 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  28.39 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  29.17 
 
 
202 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 
197 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  31.65 
 
 
250 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  21.88 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03321  hypothetical protein  28.21 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.637267  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03331  hypothetical protein  28.85 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  25.85 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1878  hypothetical protein  27.41 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.826687  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0310  hypothetical protein  27.16 
 
 
211 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.237203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  26.34 
 
 
227 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  26.76 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  25.56 
 
 
197 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  26.97 
 
 
237 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1679  hypothetical protein  23.66 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0162437  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0989  SNARE associated Golgi protein  25.58 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03931  hypothetical protein  23.66 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.748515  normal  0.0749833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  26.26 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.11 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  28 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  26.72 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.03 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  26.11 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03691  hypothetical protein  28.69 
 
 
246 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  25.77 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0962  SNARE associated Golgi protein  25.58 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  26.95 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  26.92 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  28.81 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  26.62 
 
 
233 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  25.56 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  25.56 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  25.56 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  25.56 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  29.41 
 
 
714 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0449  hypothetical protein  26.36 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0743874  normal  0.23967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  25.56 
 
 
236 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  28.67 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  26.45 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1879  SNARE associated Golgi protein  30.34 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302356  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 
229 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  21.84 
 
 
704 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.16 
 
 
251 aa  45.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  28 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  23.39 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  28.85 
 
 
198 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  26.23 
 
 
220 aa  45.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1711  hypothetical protein  23.15 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.427303  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04261  hypothetical protein  23.15 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  26.24 
 
 
240 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  27.45 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03421  hypothetical protein  27.5 
 
 
171 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0314258  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  26.62 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>