More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1164 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  100 
 
 
431 aa  881  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  50.49 
 
 
434 aa  418  1e-115  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  50.24 
 
 
434 aa  416  1e-115  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  49.77 
 
 
449 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  48.11 
 
 
434 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  47.88 
 
 
434 aa  402  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  46.96 
 
 
454 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.36 
 
 
438 aa  362  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  44.28 
 
 
435 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.21997e-06  hitchhiker  7.85503e-07 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  43.61 
 
 
449 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  42.99 
 
 
436 aa  358  9e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  43.53 
 
 
451 aa  355  7e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  7.47616e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  42.79 
 
 
450 aa  355  9e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  42.79 
 
 
450 aa  355  9e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  42.55 
 
 
450 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  42.55 
 
 
450 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  42.93 
 
 
450 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  42.55 
 
 
450 aa  352  6e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  42.55 
 
 
450 aa  352  6e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  42.55 
 
 
450 aa  352  6e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  42.55 
 
 
450 aa  352  6e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.22 
 
 
466 aa  352  8e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  42.55 
 
 
450 aa  352  9e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  42.68 
 
 
450 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.68 
 
 
450 aa  349  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  41.35 
 
 
448 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  41.35 
 
 
448 aa  344  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.6 
 
 
450 aa  338  1e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  40.24 
 
 
448 aa  332  8e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  42.79 
 
 
446 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.62 
 
 
471 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  41.73 
 
 
439 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.21 
 
 
429 aa  320  4e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.81 
 
 
429 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.72 
 
 
432 aa  313  5e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.14049e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.29 
 
 
438 aa  308  1e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.03 
 
 
439 aa  304  2e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.24 
 
 
431 aa  304  2e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.24 
 
 
435 aa  303  3e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  2.07484e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.14 
 
 
444 aa  302  7e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.4 
 
 
456 aa  302  7e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  4.54579e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  36.83 
 
 
441 aa  302  7e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  38.19 
 
 
437 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.6 
 
 
434 aa  299  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  37.85 
 
 
438 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.19 
 
 
425 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  35.7 
 
 
458 aa  296  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.12 
 
 
449 aa  295  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.66 
 
 
444 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.34 
 
 
441 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.33 
 
 
442 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.68 
 
 
442 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.2 
 
 
430 aa  289  7e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  36.27 
 
 
440 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.29 
 
 
495 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.32 
 
 
427 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.57 
 
 
411 aa  276  5e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  37.47 
 
 
436 aa  275  1e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.27 
 
 
444 aa  273  4e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  34.94 
 
 
440 aa  273  5e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  36.08 
 
 
451 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.10311e-07  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.84 
 
 
429 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.07 
 
 
420 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.56 
 
 
434 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.52 
 
 
438 aa  260  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  35.43 
 
 
413 aa  259  5e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.66 
 
 
421 aa  259  6e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  37.15 
 
 
451 aa  259  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  4.17118e-07  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.54 
 
 
417 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  5.62047e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.27 
 
 
451 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.5 
 
 
434 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  34.86 
 
 
416 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  37.94 
 
 
451 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  36.87 
 
 
480 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  34.7 
 
 
452 aa  256  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.81 
 
 
443 aa  255  8e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.62 
 
 
421 aa  254  1e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.77 
 
 
449 aa  255  1e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  36.32 
 
 
446 aa  254  2e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.95 
 
 
416 aa  254  3e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  33.9 
 
 
447 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.99 
 
 
471 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  35.99 
 
 
444 aa  250  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.42644e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0298  RNA modification enzyme, MiaB family  33.92 
 
 
431 aa  249  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.89 
 
 
409 aa  249  5e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2722  hypothetical protein  33.33 
 
 
435 aa  249  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  33.89 
 
 
470 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.3 
 
 
449 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  33.67 
 
 
443 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.33 
 
 
447 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.61297e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.23 
 
 
471 aa  246  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.13 
 
 
416 aa  244  2e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.1 
 
 
441 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1749  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.31 
 
 
451 aa  243  4e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.49639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  36.04 
 
 
449 aa  242  8e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  32.95 
 
 
450 aa  242  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.05 
 
 
419 aa  242  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.41 
 
 
467 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3285  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.87 
 
 
436 aa  240  3e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2378  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.25 
 
 
464 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0197332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>