263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1150 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  100 
 
 		 49 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 55 aa  69.3  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  71.11 
 
 		 54 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  65.31 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  67.39 
 
 		 52 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  61.22 
 
 		 49 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  65.31 
 
 		 49 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  62.22 
 
 		 56 aa  64.3  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  57.14 
 
 		 49 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  64.3  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  62.22 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  64.44 
 
 		 49 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  61.7 
 
 		 50 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  61.7 
 
 		 50 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  60.87 
 
 		 54 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  58.7 
 
 		 56 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  61.6  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  57.14 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  56 
 
 		 54 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  57.14 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  51.02 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  60.87 
 
 		 54 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2079  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.958613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  62.22 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  58.7 
 
 		 56 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 54 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  56.52 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  54.35 
 
 		 56 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  56.52 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  57.45 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0687  50S ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 49 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0119  ribosomal protein L33  65.12 
 
 		 43 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  58.7 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  58.7 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 52 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  54.35 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  56.52 
 
 		 55 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  58.7 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2428  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000103029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 52 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  52.17 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  56.52 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 52 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 52 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0346  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 50 aa  56.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000111455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6067  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412873  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  52.17 
 
 		 55 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 54 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 52 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1542  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  normal  0.759054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  52.17 
 
 		 54 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>