More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1136 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  100 
 
 
544 aa  1090    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  43.45 
 
 
600 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  41.04 
 
 
595 aa  352  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  40.81 
 
 
599 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.9 
 
 
587 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.17 
 
 
605 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  44.51 
 
 
595 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  39.47 
 
 
596 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  44.23 
 
 
595 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  34.27 
 
 
604 aa  321  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.97 
 
 
588 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  36.89 
 
 
599 aa  319  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.6 
 
 
587 aa  316  9e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38 
 
 
601 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.49 
 
 
599 aa  312  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  38.25 
 
 
604 aa  312  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.34 
 
 
611 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.96 
 
 
593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  37.3 
 
 
617 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.86 
 
 
619 aa  299  9e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.79 
 
 
571 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.94 
 
 
613 aa  299  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.05 
 
 
598 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  41.46 
 
 
601 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  37.88 
 
 
660 aa  296  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.52 
 
 
600 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.79 
 
 
598 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.48 
 
 
588 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.52 
 
 
598 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.52 
 
 
598 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  37.44 
 
 
582 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  37.44 
 
 
582 aa  293  5e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  37.44 
 
 
582 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  38.93 
 
 
573 aa  292  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.95 
 
 
583 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  34.57 
 
 
614 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.95 
 
 
582 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  36.68 
 
 
582 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  34.97 
 
 
585 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  35.33 
 
 
584 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.53 
 
 
584 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.86 
 
 
601 aa  289  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  39.3 
 
 
598 aa  289  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  37.35 
 
 
660 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  37.19 
 
 
584 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  36.36 
 
 
601 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  39.52 
 
 
617 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  33.33 
 
 
599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  42.66 
 
 
633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.69 
 
 
581 aa  286  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  39.63 
 
 
579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  38.4 
 
 
575 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.79 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.79 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.79 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.79 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.79 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.79 
 
 
581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.79 
 
 
581 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.05 
 
 
663 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  36.18 
 
 
584 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  36.18 
 
 
584 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  38.36 
 
 
614 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  38.58 
 
 
609 aa  282  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.04 
 
 
662 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  38.16 
 
 
576 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  40.28 
 
 
587 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  31.61 
 
 
638 aa  281  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  37.67 
 
 
604 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  34.56 
 
 
581 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  34.56 
 
 
581 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.05 
 
 
664 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  40.24 
 
 
564 aa  280  6e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  35.48 
 
 
586 aa  280  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  37.57 
 
 
581 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  37.57 
 
 
581 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  37.57 
 
 
581 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  38.87 
 
 
576 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  37.12 
 
 
591 aa  279  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  37.57 
 
 
581 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  37.57 
 
 
581 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  39.24 
 
 
571 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  39.69 
 
 
586 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  34.89 
 
 
574 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  35.13 
 
 
578 aa  277  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.21 
 
 
651 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.05 
 
 
660 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.95 
 
 
655 aa  277  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  33.99 
 
 
605 aa  276  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.1 
 
 
588 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  34.82 
 
 
577 aa  276  8e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  41.42 
 
 
578 aa  276  8e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  35.05 
 
 
606 aa  276  9e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.01 
 
 
652 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36.53 
 
 
636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>