More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1107 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06520  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.58 
 
 
1243 aa  1003    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.57325 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0025  phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative  42.73 
 
 
1241 aa  965    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.435502  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0046  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.59 
 
 
1236 aa  1033    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0861  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.16 
 
 
1244 aa  1001    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1471  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  41.93 
 
 
1284 aa  981    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0680923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0499  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.73 
 
 
1256 aa  1014    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000277776  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.8 
 
 
1251 aa  984    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0554  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.53 
 
 
1256 aa  988    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.749527  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13720  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.02 
 
 
1254 aa  988    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0351  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.1 
 
 
1251 aa  1016    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2106  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.97 
 
 
1244 aa  1020    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2183  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.96 
 
 
1252 aa  1013    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0671  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.7 
 
 
1266 aa  1031    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  46.01 
 
 
1266 aa  1037    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.37 
 
 
1293 aa  1017    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.611392  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0050  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  43.72 
 
 
1241 aa  988    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0300  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  46.68 
 
 
1231 aa  1065    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0262  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.75 
 
 
1238 aa  1018    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.414169  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  100 
 
 
1631 aa  3294    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.36 
 
 
591 aa  347  7e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.45 
 
 
419 aa  347  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.47 
 
 
423 aa  342  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.81 
 
 
419 aa  336  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.62 
 
 
425 aa  334  7.000000000000001e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.04 
 
 
419 aa  331  9e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.45 
 
 
423 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0676  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.2 
 
 
416 aa  330  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
423 aa  329  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 
423 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.65 
 
 
423 aa  327  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.86 
 
 
423 aa  327  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.1 
 
 
425 aa  327  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.52 
 
 
422 aa  326  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1913  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.81 
 
 
417 aa  326  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0678  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.2 
 
 
416 aa  326  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.13 
 
 
424 aa  323  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.43 
 
 
704 aa  322  3e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.27 
 
 
429 aa  322  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0492  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.59 
 
 
414 aa  321  7e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0233  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 
417 aa  320  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 
423 aa  320  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2113  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.06 
 
 
416 aa  320  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000276572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.96 
 
 
423 aa  320  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0949  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.18 
 
 
417 aa  317  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.63 
 
 
428 aa  316  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.67 
 
 
430 aa  315  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 
428 aa  315  5.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.28 
 
 
424 aa  314  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
429 aa  309  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 
423 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.19 
 
 
429 aa  310  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 
425 aa  308  7e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.57 
 
 
423 aa  308  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0504  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.71 
 
 
416 aa  308  8.000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0424  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.33 
 
 
426 aa  307  9.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.43 
 
 
423 aa  307  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.43 
 
 
428 aa  306  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.48 
 
 
427 aa  307  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.43 
 
 
423 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1416  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.13 
 
 
413 aa  305  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000507728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0475  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
416 aa  305  4.0000000000000003e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.49391  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  42.62 
 
 
403 aa  305  5.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  39.01 
 
 
430 aa  305  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1261  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.33 
 
 
415 aa  305  6.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.67 
 
 
423 aa  304  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.67 
 
 
423 aa  304  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.37 
 
 
427 aa  303  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.86 
 
 
435 aa  303  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0597  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.52 
 
 
424 aa  303  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1387  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.43 
 
 
416 aa  303  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.91 
 
 
423 aa  303  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
423 aa  302  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.08 
 
 
427 aa  302  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1266  phosphoribosylamine--glycine ligase  41.19 
 
 
416 aa  302  4e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.83 
 
 
429 aa  302  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
426 aa  302  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.71 
 
 
423 aa  301  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  41.81 
 
 
419 aa  301  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.33 
 
 
421 aa  301  1e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.71 
 
 
430 aa  300  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.09 
 
 
427 aa  299  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  39.2 
 
 
433 aa  300  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
423 aa  300  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.58 
 
 
430 aa  299  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.05 
 
 
420 aa  299  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  42 
 
 
425 aa  299  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.66 
 
 
424 aa  299  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 
429 aa  299  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.35 
 
 
433 aa  299  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.34 
 
 
427 aa  299  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.48 
 
 
428 aa  299  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  38.88 
 
 
432 aa  298  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.95 
 
 
427 aa  298  6e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  40.75 
 
 
432 aa  298  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.24 
 
 
429 aa  297  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.48 
 
 
428 aa  297  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  37.53 
 
 
456 aa  297  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.47 
 
 
423 aa  297  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.71 
 
 
423 aa  296  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  39.29 
 
 
431 aa  296  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>