More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1092 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  100 
 
 
303 aa  593  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  42.59 
 
 
301 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  38.85 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  39.06 
 
 
295 aa  208  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
295 aa  208  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  42.18 
 
 
323 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
291 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  39.92 
 
 
357 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
347 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  34.72 
 
 
341 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 
343 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  36.48 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  36.48 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  32.53 
 
 
346 aa  130  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  31.87 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  30 
 
 
342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
334 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  31.56 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  31.56 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
341 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  33.33 
 
 
334 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  33.02 
 
 
334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  33.02 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  34.52 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  34.52 
 
 
252 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  33.02 
 
 
327 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  29.87 
 
 
327 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  27.22 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  32.57 
 
 
279 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
340 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  25.56 
 
 
312 aa  109  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
340 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
340 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  33.5 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
340 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
340 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
340 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  27.53 
 
 
340 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  26.9 
 
 
340 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  33.02 
 
 
346 aa  107  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  27.54 
 
 
370 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  27.43 
 
 
360 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  27.01 
 
 
370 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  29.13 
 
 
353 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  27.91 
 
 
353 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  27.43 
 
 
370 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  29.13 
 
 
321 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  29.49 
 
 
328 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  29.15 
 
 
360 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  29.28 
 
 
346 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
346 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  28.29 
 
 
353 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  26.72 
 
 
340 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2911  Signal transduction histidine kinase-like  31.06 
 
 
614 aa  95.5  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
360 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  34.84 
 
 
322 aa  93.6  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 
1138 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
438 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
621 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0793237  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
603 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  29.25 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  29.25 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
601 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 
567 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  29.18 
 
 
1384 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  30.05 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  28.57 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 
686 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  30.05 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  30.05 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0957  Signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  30.26 
 
 
562 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  24.48 
 
 
610 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 
610 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 
610 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  30.05 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 
611 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
606 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  29.58 
 
 
474 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
556 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  24.64 
 
 
606 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  26.78 
 
 
540 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2974  histidine kinase  27.27 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.355012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  28.69 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.3 
 
 
606 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  25.21 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  24.45 
 
 
602 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>