96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1077 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  100 
 
 		 444 aa  891    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3187  hypothetical protein  23.47 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0947704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2372  hypothetical protein  22.79 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1154  hypothetical protein  25.06 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4488  hypothetical protein  23.45 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  29 
 
 		 637 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  29.73 
 
 		 635 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  28.81 
 
 		 650 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  27.72 
 
 		 629 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0670  GTP-binding protein  25.13 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.417298  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  23.83 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.32 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2984  GTPase associated putative protein/domain-like protein  33.57 
 
 		 168 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.22109 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.21 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  28.49 
 
 		 614 aa  51.6  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  27.6 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0264  GTP-binding protein  25.47 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3510  hypothetical protein  21.91 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.376537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0657  hypothetical protein  22.53 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  30.49 
 
 		 295 aa  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  28.77 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  30 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  26.61 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2503  GTP-binding protein EngA  30.15 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4957  tRNA modification GTPase TrmE  31.21 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  28.21 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0319  small GTP-binding protein  30.94 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.236663 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14040  GTP-binding protein EngA  30.28 
 
 		 512 aa  47.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.732945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  22.9 
 
 		 288 aa  47.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2826  small GTP-binding protein  30.15 
 
 		 463 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000744132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 300 aa  46.6  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  27.56 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  23.24 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23560  tRNA modification GTPase TrmE  29.12 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.690968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  27.32 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1965  tRNA modification GTPase TrmE  28.67 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0504  GTP-binding protein EngA  27.49 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  28.93 
 
 		 883 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2153  kinase  29.47 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  29.14 
 
 		 885 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3000  GTP-binding protein  28.79 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  27.5 
 
 		 882 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  24.23 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  23.79 
 
 		 290 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  31.03 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4245  tRNA modification GTPase TrmE  27.56 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00411948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0676  translation initiation factor IF-2  28.38 
 
 		 874 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.391242  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19830  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  32.82 
 
 		 531 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  24.79 
 
 		 290 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  23.93 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  25.14 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  21.66 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  23.79 
 
 		 290 aa  45.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0214  GTP-binding protein Era  29.48 
 
 		 293 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.890226  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1272  GTP-binding protein EngA  30.6 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1538  GTP-binding protein EngA  30.37 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0501467  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2124  tRNA modification GTPase TrmE  26.39 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4387  translation initiation factor IF-2  29.66 
 
 		 917 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.582492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  27.33 
 
 		 884 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0199  tRNA modification GTPase TrmE  26.39 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  25 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15170  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  31.85 
 
 		 527 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00982196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  24.49 
 
 		 301 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.49 
 
 		 493 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  27.6 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  26.42 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  29.37 
 
 		 398 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0463  bifunctional cytidylate kinase/GTP-binding protein  30 
 
 		 709 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.816012  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  22.43 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2482  hypothetical protein  21.33 
 
 		 409 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0321451  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  28.67 
 
 		 679 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  28.67 
 
 		 679 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 		 964 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  29.8 
 
 		 290 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4034  tRNA modification GTPase TrmE  28.46 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461545  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  26.83 
 
 		 658 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  27.67 
 
 		 921 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0407  GTP-binding protein Era  24.07 
 
 		 311 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  26.02 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0980  ribosome-associated GTPase EngA  31.82 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1565  cytidylate kinase  31.3 
 
 		 725 aa  43.1  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  26.02 
 
 		 301 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  29.1 
 
 		 440 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  23.02 
 
 		 302 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  25 
 
 		 301 aa  43.1  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3920  tRNA modification GTPase TrmE  26.8 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03534  hypothetical protein  26.8 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4216  tRNA modification GTPase TrmE  26.8 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.021791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03590  tRNA modification GTPase  26.8 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2148  small GTP-binding protein  30.08 
 
 		 495 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  29.03 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  28.57 
 
 		 663 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4288  tRNA modification GTPase TrmE  26.8 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  29.63 
 
 		 516 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4260  tRNA modification GTPase TrmE  26.8 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4219  tRNA modification GTPase TrmE  26.8 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.99545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>