17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1075 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1075  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1533  hypothetical protein  31.89 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.975829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0770  hypothetical protein  32.84 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000115194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0812  hypothetical protein  31.1 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0824  hypothetical protein  30.49 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000195088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4483  putative ABC transporter, permease protein  26.71 
 
 
244 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0711  hypothetical protein  26.09 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0853  putative ABC transporter, permease protein  26.81 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0198  hypothetical protein  23.57 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.485643  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0710  permease  26.09 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.251527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0891  ABC transporter, permease protein, putative  24.64 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0963  putative ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0761  ABC transporter permease  24.64 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0696  permease  24.64 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0800  ABC transporter permease  24.64 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0895  putative ABC transporter, permease protein  24.64 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41872e-39 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf720  hypothetical protein  27.7 
 
 
305 aa  43.1  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.898469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>