More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1008 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 460 aa  946    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  50.85 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  52.19 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  50.89 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  47.32 
 
 		 450 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  47.56 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  47.78 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  48.63 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  45.39 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 		 456 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  40.13 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  38.86 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  43.02 
 
 		 458 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  42.58 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  44.31 
 
 		 489 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 485 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  28.63 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 476 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 403 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 468 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 462 aa  122  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 518 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 728 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 351 aa  116  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 467 aa  103  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 453 aa  103  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 440 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.93 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 365 aa  99  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.14 
 
 		 438 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  22.31 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 481 aa  93.6  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  23.04 
 
 		 432 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  22.31 
 
 		 507 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 391 aa  90.5  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 459 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 450 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 399 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  27.41 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 345 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  26.1 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  27.38 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  24.06 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  24.06 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  26.25 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>