191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0984 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  54.63 
 
 
262 aa  231  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  52.29 
 
 
261 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  47.96 
 
 
243 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  49.28 
 
 
235 aa  206  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  47.75 
 
 
244 aa  199  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.92 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.16 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  47.69 
 
 
262 aa  194  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  49.08 
 
 
243 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  49.08 
 
 
243 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.7 
 
 
243 aa  187  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.66 
 
 
251 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  42.86 
 
 
241 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  42.72 
 
 
241 aa  184  9e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  44.93 
 
 
246 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  44.19 
 
 
227 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  40.83 
 
 
270 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  40.27 
 
 
250 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.29 
 
 
248 aa  174  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.89 
 
 
248 aa  174  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.67 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.01 
 
 
238 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  41.47 
 
 
243 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  40.83 
 
 
243 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  38.43 
 
 
245 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  40.55 
 
 
744 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40 
 
 
255 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.14 
 
 
242 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.51 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  39.07 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  39.07 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  37.21 
 
 
241 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  41.33 
 
 
270 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.88 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  38.6 
 
 
272 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  34.58 
 
 
240 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  37.5 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.78 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.45 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.78 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  34.88 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  32.23 
 
 
235 aa  121  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.91 
 
 
262 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  31.55 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  33.97 
 
 
236 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  31.25 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  31.1 
 
 
238 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  32.06 
 
 
238 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  30.84 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  30.84 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.42 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  31.43 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  33.79 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.01 
 
 
236 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 
238 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  28.64 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
240 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  31.34 
 
 
272 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  31.9 
 
 
240 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  30.49 
 
 
250 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.52 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.49 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  29.95 
 
 
247 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  35.86 
 
 
492 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  35.86 
 
 
492 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  27.49 
 
 
490 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  28.34 
 
 
490 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  26.46 
 
 
484 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  25 
 
 
484 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  26.46 
 
 
484 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  30.37 
 
 
483 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  27.75 
 
 
483 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  30.37 
 
 
506 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  32 
 
 
501 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  30.4 
 
 
532 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  26.89 
 
 
485 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  30.71 
 
 
787 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  24.34 
 
 
484 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  25.98 
 
 
488 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  27.08 
 
 
511 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  27.08 
 
 
511 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  31.45 
 
 
797 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  28.34 
 
 
485 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  29.78 
 
 
509 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  24.74 
 
 
498 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  24.36 
 
 
501 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  27.18 
 
 
491 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  29.84 
 
 
492 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  27.27 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  27.17 
 
 
517 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  25.81 
 
 
489 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  25.88 
 
 
489 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  26.55 
 
 
500 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  28.57 
 
 
491 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  28.23 
 
 
477 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  25.41 
 
 
504 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  26.42 
 
 
485 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  28.67 
 
 
503 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  31.15 
 
 
481 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>