More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0982 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.91 
 
 
730 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.91 
 
 
730 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.61 
 
 
732 aa  638    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  100 
 
 
731 aa  1469    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.37 
 
 
729 aa  635  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  45.65 
 
 
757 aa  632  1e-180  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.18 
 
 
711 aa  626  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.4 
 
 
741 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.77 
 
 
747 aa  624  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.49 
 
 
753 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.3 
 
 
741 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.94 
 
 
757 aa  620  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  44.22 
 
 
753 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.3 
 
 
751 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.16 
 
 
747 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.49 
 
 
753 aa  618  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.16 
 
 
751 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  44.16 
 
 
751 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  48.33 
 
 
785 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.16 
 
 
747 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.65 
 
 
725 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.16 
 
 
751 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.04 
 
 
751 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.04 
 
 
751 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.46 
 
 
759 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.78 
 
 
715 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.64 
 
 
758 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.18 
 
 
766 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.23 
 
 
718 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.65 
 
 
748 aa  594  1e-168  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.22 
 
 
729 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.21 
 
 
755 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.88 
 
 
730 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  43.35 
 
 
770 aa  588  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  41.63 
 
 
739 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.55 
 
 
737 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.18 
 
 
742 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.11 
 
 
694 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  42.47 
 
 
807 aa  561  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.13 
 
 
762 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.78 
 
 
765 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  41.5 
 
 
768 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.89 
 
 
786 aa  558  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  40.59 
 
 
744 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.99 
 
 
797 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  42.06 
 
 
707 aa  555  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.11 
 
 
858 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.16 
 
 
754 aa  552  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.87 
 
 
773 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.69 
 
 
806 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.41 
 
 
781 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.48 
 
 
831 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  40.88 
 
 
757 aa  548  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  41.68 
 
 
741 aa  547  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.53 
 
 
756 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  40.49 
 
 
736 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.37 
 
 
772 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  40.73 
 
 
746 aa  547  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.28 
 
 
781 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.97 
 
 
763 aa  547  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.75 
 
 
794 aa  544  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  39.1 
 
 
762 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.3 
 
 
795 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3361  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.52 
 
 
772 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.876798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.77 
 
 
772 aa  540  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  39.76 
 
 
759 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  39.31 
 
 
737 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.78 
 
 
829 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.57 
 
 
838 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.78 
 
 
858 aa  535  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.09 
 
 
851 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  39.56 
 
 
732 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.33 
 
 
794 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.3 
 
 
797 aa  535  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  42.76 
 
 
724 aa  529  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  39.17 
 
 
751 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  39.69 
 
 
771 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.23 
 
 
833 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.34 
 
 
768 aa  529  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  42.57 
 
 
726 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.7 
 
 
738 aa  526  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40 
 
 
802 aa  528  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.35 
 
 
1023 aa  526  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.9 
 
 
776 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  40.48 
 
 
738 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  40.51 
 
 
738 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  38.85 
 
 
762 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  41.92 
 
 
735 aa  525  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  37.52 
 
 
787 aa  524  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  42.95 
 
 
714 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  39.27 
 
 
731 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  39.65 
 
 
705 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  39.34 
 
 
721 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.77 
 
 
784 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.55 
 
 
857 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.66 
 
 
785 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  43.33 
 
 
735 aa  520  1e-146  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.66 
 
 
785 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  38.95 
 
 
764 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  40.43 
 
 
741 aa  517  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>