More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0976 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 390 aa  779    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.270642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.13 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.22 
 
 		 515 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.75 
 
 		 516 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.07 
 
 		 510 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  40.81 
 
 		 517 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  38.21 
 
 		 499 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  37.5 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.87 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.25 
 
 		 524 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.56 
 
 		 500 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.32 
 
 		 511 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  37.91 
 
 		 530 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.89 
 
 		 525 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.7 
 
 		 524 aa  179  7e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.3 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.82 
 
 		 533 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.11 
 
 		 533 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.46 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.74 
 
 		 521 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.38 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.87 
 
 		 524 aa  169  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  36.43 
 
 		 514 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.03 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  36.4 
 
 		 512 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  34.51 
 
 		 512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.25 
 
 		 521 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.32 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.34 
 
 		 492 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.22 
 
 		 509 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.51 
 
 		 524 aa  161  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.11 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.42 
 
 		 493 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  34.62 
 
 		 522 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  34.12 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.77 
 
 		 512 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.46 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.57 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.01 
 
 		 502 aa  156  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 		 494 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 		 494 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.21 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.35 
 
 		 504 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.36 
 
 		 517 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.44 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.16 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 512 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.11 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.45 
 
 		 542 aa  150  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.43 
 
 		 499 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  34.88 
 
 		 513 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.43 
 
 		 499 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  33.7 
 
 		 499 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  36.43 
 
 		 496 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  31.44 
 
 		 515 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  31.44 
 
 		 515 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.44 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.1 
 
 		 521 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  31.44 
 
 		 515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4690  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.88 
 
 		 286 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.993931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  31.44 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  30.89 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  31.44 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  31.44 
 
 		 515 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  31.44 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.07 
 
 		 499 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 488 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  35.98 
 
 		 524 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.65 
 
 		 499 aa  146  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.5 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.86 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.58 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.5 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  33.58 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.71 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.67 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.71 
 
 		 492 aa  143  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.48 
 
 		 507 aa  143  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.96 
 
 		 502 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  32.52 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  35.09 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.73 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479254  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  32.85 
 
 		 503 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.25 
 
 		 528 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  32.22 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  33.71 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  32.09 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.45 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.95 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  32.22 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.79 
 
 		 516 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.6 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.99 
 
 		 498 aa  136  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.5 
 
 		 490 aa  135  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>