More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0936 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
876 aa  695    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
876 aa  694    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
871 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
875 aa  705    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
874 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
876 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
867 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
874 aa  652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
884 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
880 aa  694    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
876 aa  659    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0613  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
842 aa  640    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
863 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
874 aa  694    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
874 aa  652    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
874 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
880 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
880 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
880 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
874 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
860 aa  682    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
860 aa  694    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
899 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
886 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
871 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
863 aa  719    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
874 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
874 aa  731    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
886 aa  672    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 
896 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
880 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
874 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  41.3 
 
 
873 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
874 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
876 aa  704    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
882 aa  723    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
897 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
872 aa  661    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
886 aa  674    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
876 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
880 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
864 aa  712    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
880 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
874 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
886 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
876 aa  731    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
862 aa  685    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0534  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
842 aa  642    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 
881 aa  701    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
874 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
905 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
879 aa  703    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
860 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
875 aa  652    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
874 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
876 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
875 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
890 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
874 aa  686    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 
878 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
874 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
874 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
891 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
868 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
897 aa  637    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 
890 aa  642    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
884 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0205  alanyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
884 aa  644    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
892 aa  672    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
871 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
876 aa  666    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
897 aa  712    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
865 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
878 aa  706    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
874 aa  673    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
879 aa  774    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
879 aa  773    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
874 aa  676    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
874 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
874 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
874 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
869 aa  681    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
874 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
880 aa  678    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  48 
 
 
880 aa  788    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
874 aa  709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
874 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
874 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
874 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 
882 aa  702    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
874 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
875 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
897 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
885 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
878 aa  674    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
874 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
892 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
878 aa  721    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
867 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
880 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>