More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0929 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
426 aa  848    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  54.67 
 
 
427 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  51.05 
 
 
424 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.37 
 
 
425 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.69 
 
 
426 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.23 
 
 
423 aa  378  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.56 
 
 
429 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  47.78 
 
 
422 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  48.48 
 
 
428 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  46.62 
 
 
428 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  46.62 
 
 
428 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  46.62 
 
 
432 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  47 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  46.62 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.63 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.57 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  46.26 
 
 
428 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  46.39 
 
 
435 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  46.15 
 
 
428 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  46.15 
 
 
428 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  44 
 
 
426 aa  332  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  45.92 
 
 
428 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  45.92 
 
 
428 aa  332  8e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  45.92 
 
 
428 aa  332  8e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  45.12 
 
 
430 aa  332  9e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  45.12 
 
 
430 aa  332  9e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  45.92 
 
 
428 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  46.15 
 
 
428 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  44.91 
 
 
430 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  46.77 
 
 
435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.69 
 
 
452 aa  329  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  45.45 
 
 
428 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  45.18 
 
 
428 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  45.54 
 
 
427 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  47.89 
 
 
425 aa  325  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  43.15 
 
 
439 aa  325  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.77 
 
 
438 aa  323  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.78 
 
 
437 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  47.32 
 
 
439 aa  321  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  44.68 
 
 
434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  45.65 
 
 
439 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.97 
 
 
482 aa  318  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  53.33 
 
 
353 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.54 
 
 
439 aa  316  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  44.01 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  44.99 
 
 
419 aa  312  7.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.72 
 
 
463 aa  312  9e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.01 
 
 
354 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.01 
 
 
354 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.01 
 
 
354 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  43.62 
 
 
428 aa  311  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.99 
 
 
454 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.58 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.66 
 
 
387 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  45.88 
 
 
423 aa  305  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.13 
 
 
464 aa  305  9.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  52.76 
 
 
346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.24 
 
 
333 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  48.64 
 
 
397 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  37.78 
 
 
500 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.82 
 
 
338 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  46.76 
 
 
353 aa  299  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  47.29 
 
 
424 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  48.94 
 
 
364 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  42.99 
 
 
436 aa  296  6e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  50.46 
 
 
327 aa  295  7e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  48.64 
 
 
364 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.31 
 
 
338 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  51.34 
 
 
363 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50 
 
 
338 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.76 
 
 
427 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  45.2 
 
 
370 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.06 
 
 
435 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  49.11 
 
 
366 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  50.45 
 
 
350 aa  292  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  43.02 
 
 
437 aa  292  7e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  47.92 
 
 
338 aa  292  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.14 
 
 
464 aa  291  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  48.34 
 
 
366 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.97 
 
 
432 aa  290  3e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.94 
 
 
458 aa  290  3e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  48.33 
 
 
365 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  47.46 
 
 
346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  46.86 
 
 
361 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  48.33 
 
 
365 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  43.17 
 
 
397 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.64 
 
 
343 aa  289  8e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  49.38 
 
 
338 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  46.15 
 
 
362 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  48.07 
 
 
354 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  49.38 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  47.29 
 
 
364 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  45.98 
 
 
350 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.66 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  45.56 
 
 
337 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  38.98 
 
 
516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  45.85 
 
 
379 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  47.15 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  48.05 
 
 
336 aa  282  8.000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>