More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0907 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
372 aa  776    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  65.23 
 
 
375 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.89 
 
 
380 aa  499  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  62.26 
 
 
373 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.51 
 
 
379 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.88 
 
 
379 aa  497  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.46 
 
 
374 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.73 
 
 
380 aa  497  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.51 
 
 
379 aa  497  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.65 
 
 
370 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.27 
 
 
380 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.65 
 
 
379 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.75 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.75 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.75 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.75 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.75 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.75 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.02 
 
 
379 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.48 
 
 
379 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.65 
 
 
380 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.75 
 
 
379 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.48 
 
 
379 aa  478  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.22 
 
 
382 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  60 
 
 
369 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.92 
 
 
373 aa  474  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.99 
 
 
373 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.06 
 
 
372 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.17 
 
 
370 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.33 
 
 
357 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.79 
 
 
371 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  60 
 
 
370 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.49 
 
 
370 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.5 
 
 
379 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 
373 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.98 
 
 
369 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.92 
 
 
372 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.92 
 
 
372 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.14 
 
 
384 aa  432  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.31 
 
 
371 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.41 
 
 
394 aa  429  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.87 
 
 
386 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.26 
 
 
377 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.03 
 
 
379 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 
367 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.61 
 
 
387 aa  421  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.97 
 
 
374 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.2 
 
 
380 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.76 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.91 
 
 
388 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.74 
 
 
395 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.9 
 
 
368 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.59 
 
 
375 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.55 
 
 
372 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.99 
 
 
383 aa  408  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.39 
 
 
365 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.74 
 
 
379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.72 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.88 
 
 
377 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.63 
 
 
368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.87 
 
 
376 aa  404  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  53.91 
 
 
382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 
376 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 
377 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.63 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.68 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 
368 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.94 
 
 
384 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 
378 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.62 
 
 
383 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 
367 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.63 
 
 
373 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.48 
 
 
377 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 
367 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.14 
 
 
372 aa  395  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.97 
 
 
392 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
380 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.96 
 
 
376 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1289  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  53.96 
 
 
347 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0376  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  48.85 
 
 
406 aa  396  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0401753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.57 
 
 
385 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 
377 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.66 
 
 
387 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 
366 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.03 
 
 
381 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1404  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
376 aa  388  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.2387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.3 
 
 
381 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.57 
 
 
387 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
388 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.03 
 
 
381 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.52 
 
 
366 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
376 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.02 
 
 
376 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.85 
 
 
374 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 
371 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.53 
 
 
387 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2520  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.56 
 
 
376 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783169  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.01 
 
 
376 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>