More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0797 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 206 aa  423  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  30.81 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  27.52 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  30.77 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  30.56 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  28.36 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.05 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 281 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  33.85 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  29.12 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  53.97 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.77 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  49.21 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  31.85 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  31.25 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  25.7 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  39.76 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  31.85 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.81 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3974  LexA repressor  33.33 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  26.88 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.38 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1678  LexA repressor  36.36 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.29341 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.36 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.36 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.36 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  25.12 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  31.11 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  32.11 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  24.64 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  32.28 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  27.8 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  28.57 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  27.8 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.9 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.25 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2029  LexA repressor  31.9 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  27.91 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  27.54 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  29.46 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  29.93 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  32.52 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.15 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  29.93 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  29.93 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  23.92 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  23.92 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  34.95 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.5 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  32.11 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25.11 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  32.11 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  35.35 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  28.57 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.25 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  32.58 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  30.15 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  33.33 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.68 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  34.69 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  30.33 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  30.77 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  25.41 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  32.03 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1772  LexA repressor  33.33 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  32.35 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  32.35 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  32.35 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  34.65 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  33.33 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1898  LexA repressor  29.1 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0832  LexA repressor  31.62 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0630209  hitchhiker  0.00461064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1419  LexA repressor  26.16 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  33.08 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  31.75 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  30.15 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  32.35 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  32.35 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2045  LexA repressor  27.27 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  32.35 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  32.35 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  32.35 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  30.83 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  33.67 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1054  SOS-response transcriptional repressor, LexA  28.67 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  33.96 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.79 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>