More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0795 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  100 
 
 
362 aa  730    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  35.04 
 
 
384 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  32.05 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  32 
 
 
393 aa  160  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  31.23 
 
 
398 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  32.63 
 
 
370 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.87 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.87 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  31.15 
 
 
369 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  31.69 
 
 
369 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  31.81 
 
 
381 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  31.04 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  31.27 
 
 
381 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  29.61 
 
 
388 aa  134  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.49 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  27.7 
 
 
409 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.98 
 
 
373 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.65 
 
 
376 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.65 
 
 
376 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  30 
 
 
376 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 
376 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.06 
 
 
390 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.93 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.44 
 
 
381 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1247  phage integrase family site specific recombinase  27.82 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.357571  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  27.3 
 
 
435 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  27.33 
 
 
393 aa  113  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  27.44 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  36.02 
 
 
209 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.98 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  27.04 
 
 
367 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  28.37 
 
 
348 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.51 
 
 
413 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.53 
 
 
378 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  25.93 
 
 
363 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.76 
 
 
383 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.39 
 
 
414 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.56 
 
 
385 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.17 
 
 
357 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.86 
 
 
391 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  27.01 
 
 
374 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.42 
 
 
454 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  24.31 
 
 
463 aa  99.4  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.72 
 
 
370 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.81 
 
 
379 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  23.53 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  24.17 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.89 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  23.94 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  29.1 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  24.48 
 
 
416 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.3 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.05 
 
 
389 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  27.36 
 
 
307 aa  92.8  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.27 
 
 
391 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  26.63 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  22.9 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  30.26 
 
 
201 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  23.67 
 
 
374 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  30.99 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.1 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  24.56 
 
 
403 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  27.33 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  25.07 
 
 
451 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  25.51 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.53 
 
 
506 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.01 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0555  phage integrase  30.59 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0470289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  26.79 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  27.21 
 
 
392 aa  87.4  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  26.79 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  21.69 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  24.46 
 
 
402 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.2 
 
 
383 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.63 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.84 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.01 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.26 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  23.68 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  23.77 
 
 
407 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0848  phage integrase family protein  26.69 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0864  phage integrase family protein  26.69 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0352184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  25.08 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  32.02 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  26.15 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  26.02 
 
 
424 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  34.94 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  34.94 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  24.71 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  28.01 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  27.75 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.01 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  27.75 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  25.6 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  27.3 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  26.98 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  22.93 
 
 
383 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  25.27 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  30 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  21.64 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>