More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0760 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 388 aa  764    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  41.05 
 
 		 376 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  41.34 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  37.93 
 
 		 378 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  36.44 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  37.06 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  35.36 
 
 		 379 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  39.94 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.09 
 
 		 398 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  35.37 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  35.69 
 
 		 366 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  35.07 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  35.54 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  36 
 
 		 407 aa  209  9e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  31.81 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 407 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  36.39 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  32.31 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  33.24 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  35.08 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  37.43 
 
 		 360 aa  205  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14200  cell division membrane protein  34.93 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  37.43 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000223269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  35.91 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  35.14 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  32.49 
 
 		 386 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  36.46 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  34.99 
 
 		 371 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  34.63 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3649  rod shape-determining protein RodA  35.71 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.115468 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  34.84 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  34.9 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  35.83 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4040  cell cycle protein  33.69 
 
 		 380 aa  199  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  33.52 
 
 		 373 aa  199  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  34.35 
 
 		 373 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  35.67 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  35.39 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  35.39 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  35 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  38.99 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  35.65 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  32.32 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  38.11 
 
 		 372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0672  rod shape-determining protein  35.24 
 
 		 353 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.722456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  35.65 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  35.65 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  34.52 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  35.89 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  36.76 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  35.6 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  37.76 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  36.57 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  36.22 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  34.25 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  34.81 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  32.52 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  36.92 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  32.7 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  33.58 
 
 		 408 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  33.61 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2013  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0547466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  32.67 
 
 		 417 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  33.42 
 
 		 377 aa  193  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  36.56 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  34.07 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  32.67 
 
 		 417 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  34.87 
 
 		 368 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.38 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  33.53 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  33.82 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  33.61 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  35.23 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  31.34 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  39.05 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  35.45 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  35.26 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0457  rod shape-determining protein RodA  36.01 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336208  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0262  cell division membrane protein  33.93 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  34.15 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  34.17 
 
 		 370 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  31.77 
 
 		 417 aa  190  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  34.79 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0621  rod shape-determining protein RodA, putative  35.26 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.898284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  34.17 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  34.74 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  35.52 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  34.15 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  34.73 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>