More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0750 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0750  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 434 aa  875    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000755075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  59.84 
 
 		 653 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  60.64 
 
 		 690 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  53.46 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  49.89 
 
 		 492 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  52.57 
 
 		 450 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  50.82 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  51.83 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  51.17 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  52.31 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0410  transcription termination factor Rho  54.2 
 
 		 650 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  51.16 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  51.61 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2471  transcription termination factor Rho  55.61 
 
 		 489 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.94389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2181  transcription termination factor Rho  55.61 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  51.42 
 
 		 642 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1864  transcription termination factor Rho  52.78 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.462467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  51.26 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  49.66 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  50.57 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  59.68 
 
 		 508 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  51.62 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  51.27 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  51.27 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  51.49 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  49.66 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  50.57 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  50.81 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  54.46 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  51.04 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  50.81 
 
 		 420 aa  413  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  51.04 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  50.34 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  51.61 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  51.72 
 
 		 449 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1252  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.180774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  51.38 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  50.68 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  50.81 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  50.35 
 
 		 415 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  51.28 
 
 		 431 aa  408  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0481  transcription termination factor Rho  49.77 
 
 		 420 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1362  transcription termination factor Rho  52.2 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  0.514608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  50.93 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0499  transcription termination factor Rho  50.94 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000619502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  50.93 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  51.16 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4662  transcription termination factor Rho  53.85 
 
 		 604 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  50.46 
 
 		 415 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  49.65 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  49.65 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  48.51 
 
 		 548 aa  404  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  50.24 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  54.81 
 
 		 518 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  50.35 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  48.51 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  49.43 
 
 		 419 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  49.89 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  49.65 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  49.43 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0978  transcription termination factor Rho  50.92 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000458631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  50.57 
 
 		 421 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  54.08 
 
 		 498 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1215  transcription termination factor Rho  49.77 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000539864  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  50.24 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  49.89 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  49.65 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1189  transcription termination factor  49.08 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000172016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  49.65 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  50.23 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  48.97 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  48.97 
 
 		 420 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  49.65 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1990  transcription termination factor Rho  50.11 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  48.51 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  50.23 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  50.23 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2341  transcription termination factor Rho  48.73 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.735775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  50.47 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2293  transcription termination factor Rho  50.11 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.182483  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  50.93 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  49.43 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  51.04 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  49.43 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  50 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0638  transcription termination factor Rho  48.05 
 
 		 420 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  50.12 
 
 		 579 aa  396  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  48.74 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  47.6 
 
 		 484 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0679  transcription termination factor Rho  48.74 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000809271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  49.89 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>