More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0684 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0684  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.84339  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0674  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  23.41 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  33.04 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 310 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 214 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 408 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1971  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 261 aa  48.5  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 288 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  32.79 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 288 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  22.02 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0657  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.184165  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  24.58 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.48 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>