More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0659 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0659  ribonuclease III  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0117044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.79 
 
 		 230 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  39.13 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.72 
 
 		 246 aa  167  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  40.87 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  39.65 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  39.56 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  38.4 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  39.24 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  39.01 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  35.17 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.09 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  39.64 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  37.72 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.56 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.33 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  37.28 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  37.08 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  37.08 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  40.52 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  36.84 
 
 		 241 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  38.43 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  35.86 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  37.45 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  40.09 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  36.16 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  40.09 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  40.09 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  35.06 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  37.39 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.2 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000342133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  37.66 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  34.73 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  40.09 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  38.12 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  36.91 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  39.27 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  39.04 
 
 		 245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1387  ribonuclease III  37.33 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.023535  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  34.06 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  34.33 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  35.68 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  32.91 
 
 		 377 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  38.7 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  35.71 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  34.2 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  35.93 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  35.93 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02998  ribonuclease III  36.82 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  37.09 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  35.93 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  38.1 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1027  ribonuclease III  34.96 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  36.4 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2807  ribonuclease III  38.79 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000160446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2228  ribonuclease III  35.11 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  34.06 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  34.86 
 
 		 383 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  32.57 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1631  ribonuclease III  34.91 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00732498  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  39.55 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1037  ribonuclease III  36.64 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00165891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  34.4 
 
 		 385 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  34.68 
 
 		 383 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  41.26 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  34.11 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  37.28 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  35.62 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  35.65 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  34.33 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  34.33 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  33.9 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  32.89 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1975  ribonuclease III  36.68 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  36.12 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  32.88 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1604  ribonuclease III  36.91 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  32.88 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  35.78 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  35.62 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  33.19 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  32.87 
 
 		 233 aa  134  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1347  ribonuclease III  32.3 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.316032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  33.64 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0333  ribonuclease III  32.78 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.283295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  35.87 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  39.72 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2245  ribonuclease III  31.3 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1375  ribonuclease III  34.51 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0880  ribonuclease III  34.65 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.199986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0367  ribonuclease III  33.91 
 
 		 265 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>