More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0645 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  100 
 
 
462 aa  921    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  37.09 
 
 
468 aa  316  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  30.09 
 
 
453 aa  244  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  34.42 
 
 
477 aa  244  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  32.71 
 
 
454 aa  225  1e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  32.31 
 
 
451 aa  216  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  31.24 
 
 
455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  29.57 
 
 
462 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
499 aa  209  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  30.69 
 
 
454 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
485 aa  200  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  28.92 
 
 
448 aa  194  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  26.78 
 
 
538 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.77 
 
 
554 aa  189  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.23 
 
 
460 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
486 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.12 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  26.11 
 
 
490 aa  183  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  26.01 
 
 
518 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
498 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.27 
 
 
525 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  24.51 
 
 
485 aa  179  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
453 aa  170  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  25.55 
 
 
475 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  26.26 
 
 
505 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
500 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  25.33 
 
 
470 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  26.51 
 
 
448 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
461 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
453 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  26.27 
 
 
453 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  22.69 
 
 
500 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
470 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  27.83 
 
 
446 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
469 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  25.05 
 
 
469 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.65 
 
 
467 aa  146  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
458 aa  146  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
458 aa  146  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  24.55 
 
 
469 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  24.55 
 
 
469 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  24.55 
 
 
469 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
445 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  23.48 
 
 
469 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.97 
 
 
463 aa  145  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  24.55 
 
 
469 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  24.34 
 
 
475 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  24.33 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  22.63 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  24.33 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  22.61 
 
 
500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  24.11 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  23.49 
 
 
463 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1007  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.03 
 
 
452 aa  140  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.77 
 
 
462 aa  139  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  27.19 
 
 
455 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  24.17 
 
 
486 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.6 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.8 
 
 
461 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.11 
 
 
464 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  22.39 
 
 
496 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
454 aa  139  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
457 aa  138  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
437 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  24.44 
 
 
466 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
463 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  28.22 
 
 
460 aa  136  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.11 
 
 
437 aa  136  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  24.09 
 
 
469 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  23.48 
 
 
469 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
475 aa  134  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  25.11 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.73 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  22.93 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.97 
 
 
477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  27.38 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  23.46 
 
 
468 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  23.57 
 
 
454 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1086  MATE efflux family protein  24.84 
 
 
616 aa  129  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000719334  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  26.81 
 
 
463 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.17 
 
 
485 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  26.12 
 
 
470 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  23.01 
 
 
469 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0308  MATE efflux family protein  24.61 
 
 
441 aa  126  7e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.426716  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
451 aa  126  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.96 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  22.91 
 
 
460 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
448 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  22.34 
 
 
492 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
457 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  22.89 
 
 
469 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  23.5 
 
 
460 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  25.92 
 
 
463 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.41 
 
 
460 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  26.34 
 
 
460 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>