More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0628 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
499 aa  640    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
631 aa  1282    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
647 aa  672    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 
499 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
491 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 
501 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
501 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 
510 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
499 aa  591  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 
497 aa  586  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 
488 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 
489 aa  573  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 
503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  56.11 
 
 
493 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 
499 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
499 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
499 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
499 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 
499 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
499 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 
499 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 
499 aa  555  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
495 aa  555  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 
499 aa  555  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
499 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 
499 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
515 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 
494 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
515 aa  542  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  55.69 
 
 
494 aa  543  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
495 aa  538  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 
494 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
490 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
508 aa  532  1e-150  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  53.89 
 
 
505 aa  527  1e-148  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
496 aa  526  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
496 aa  524  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
494 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
504 aa  504  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
503 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
491 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
492 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51.22 
 
 
496 aa  493  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
508 aa  491  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
561 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
509 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
578 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
501 aa  485  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  48.98 
 
 
491 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
494 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
505 aa  488  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
502 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 
504 aa  485  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
573 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51.38 
 
 
499 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
509 aa  479  1e-134  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
573 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 
508 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
489 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
504 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
503 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  49 
 
 
495 aa  479  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
1118 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
505 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  48.99 
 
 
505 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
505 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
502 aa  478  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
505 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
505 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
573 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
502 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 
512 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
511 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
505 aa  477  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
512 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
505 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  48.99 
 
 
505 aa  477  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
489 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
507 aa  478  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
505 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
497 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
563 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
512 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
505 aa  474  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
513 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
505 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
505 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
502 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
505 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
505 aa  474  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
492 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
492 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18281  lysyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
488 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
500 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1008  lysyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 
496 aa  472  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
505 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
505 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
503 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>