More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0627 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  52.41 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  49.02 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  48 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  49.35 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  50.35 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  51.03 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  48.23 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  49.35 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  49.32 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  54.92 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  55.56 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  48.98 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  44.87 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  45.52 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  45.52 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  47.89 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0714  GreA/GreB family elongation factor  42.76 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000638599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  45.27 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  47.01 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  44.68 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  42.36 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  43.26 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  41.13 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  41.3 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  41.22 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  41.73 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  42.22 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  43.7 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  41.79 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  45.11 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  43.07 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  41.51 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  43.97 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  43.06 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  44.06 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  44.06 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  41.48 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>