33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0559 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0559  peptidase C1A papain  100 
 
 
2353 aa  4760  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.735343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1038  hypothetical protein  42.11 
 
 
475 aa  320  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  38.69 
 
 
725 aa  278  1e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0222  peptidase C1A, papain  37.15 
 
 
497 aa  263  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107237  normal  0.0912112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  37.02 
 
 
1092 aa  251  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0903  peptidase C1A, papain  36.11 
 
 
496 aa  248  1e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  35.13 
 
 
1236 aa  234  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0305  preprotein translocase subunit SecD-like protein  26.32 
 
 
571 aa  94.4  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.303617  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  31.44 
 
 
1202 aa  87.4  3e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2326  peptidase C1A papain  31.44 
 
 
812 aa  86.3  7e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706763  normal  0.190341 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  39.02 
 
 
4630 aa  63.2  7e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  28.85 
 
 
1066 aa  61.6  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.07412e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  29.36 
 
 
1096 aa  61.2  2e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26082  predicted protein  26.5 
 
 
272 aa  60.1  5e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0135575 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.67 
 
 
1332 aa  59.3  9e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 
1077 aa  58.2  2e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf582  hypothetical lipoprotein, cysteine protease  26.23 
 
 
789 aa  58.2  2e-06  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.118517  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  26.11 
 
 
535 aa  58.5  2e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  28.22 
 
 
354 aa  58.2  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  25 
 
 
1727 aa  56.6  6e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  25.61 
 
 
368 aa  56.6  6e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0638  hypothetical protein  31.65 
 
 
884 aa  55.5  1e-05  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.102075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1318  peptidase C1A, papain  27.31 
 
 
492 aa  55.5  1e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0624769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  36.78 
 
 
2638 aa  55.1  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  26.32 
 
 
718 aa  55.1  2e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  28.57 
 
 
1300 aa  53.9  3e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  26.84 
 
 
619 aa  50.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf353  cysteine protease  25.83 
 
 
787 aa  50.4  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 
252 aa  47.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  27.06 
 
 
1732 aa  48.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.52 
 
 
1823 aa  47.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25433  predicted protein  24.87 
 
 
360 aa  47.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  51.85 
 
 
1242 aa  47.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>