More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0534 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  100 
 
 		 149 aa  286  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  48.98 
 
 		 171 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  43.66 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 147 aa  114  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  44.59 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  39.74 
 
 		 209 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 		 151 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  41.22 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  43.71 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  43.33 
 
 		 150 aa  104  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  38.26 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 168 aa  103  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.42 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 193 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  41.33 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  43.05 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  38.89 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3589  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 186 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  38.36 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  41.13 
 
 		 191 aa  99.8  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  45.61 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  40.54 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  39.73 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0571  ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.409562  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  45.61 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  40.67 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0449  50S ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 150 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00474942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  43.57 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>