More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0523 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1121 aa  2228    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  29.6 
 
 		 1242 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  28.43 
 
 		 1236 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  30.3 
 
 		 1233 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.65 
 
 		 1244 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  30.02 
 
 		 1241 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  29.12 
 
 		 1241 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  29.72 
 
 		 1241 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  29.63 
 
 		 1241 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  29.86 
 
 		 1241 aa  446  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  29.32 
 
 		 1241 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  29.72 
 
 		 1241 aa  445  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.9 
 
 		 1230 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  29.32 
 
 		 1241 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  29.48 
 
 		 1241 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  29.43 
 
 		 1240 aa  443  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  29.61 
 
 		 1248 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  29.11 
 
 		 1242 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  29.98 
 
 		 1270 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  28.24 
 
 		 1244 aa  426  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  29.98 
 
 		 1271 aa  423  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  27.87 
 
 		 1282 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  27.95 
 
 		 1217 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  27.95 
 
 		 1217 aa  412  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  28 
 
 		 1218 aa  393  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.83 
 
 		 1230 aa  384  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  27.47 
 
 		 1204 aa  372  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.29 
 
 		 1186 aa  363  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.05 
 
 		 1203 aa  342  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  29.87 
 
 		 1377 aa  335  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  25.73 
 
 		 1240 aa  318  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  27.02 
 
 		 1217 aa  317  6e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  26.46 
 
 		 1207 aa  310  1.0000000000000001e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  25.25 
 
 		 1392 aa  273  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.06 
 
 		 1251 aa  245  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  31.2 
 
 		 1392 aa  229  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  24.09 
 
 		 1080 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.57 
 
 		 1139 aa  213  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.7 
 
 		 1226 aa  195  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  23.6 
 
 		 833 aa  193  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.15 
 
 		 1405 aa  184  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  23.56 
 
 		 1251 aa  182  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 1184 aa  181  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.03 
 
 		 1156 aa  178  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  23.41 
 
 		 1180 aa  177  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.06 
 
 		 1262 aa  177  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  22.94 
 
 		 1180 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  23.05 
 
 		 1147 aa  173  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.29 
 
 		 1074 aa  171  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  23.71 
 
 		 1155 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 1120 aa  164  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  22.22 
 
 		 1123 aa  159  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 1187 aa  158  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1057 aa  157  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  25.84 
 
 		 1183 aa  157  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  22.51 
 
 		 1189 aa  156  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.78 
 
 		 1177 aa  152  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  22.48 
 
 		 1161 aa  152  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  21.69 
 
 		 1156 aa  151  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  26.61 
 
 		 1052 aa  149  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  24.45 
 
 		 1180 aa  147  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  25.74 
 
 		 1183 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  22.49 
 
 		 1159 aa  147  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  25.36 
 
 		 1089 aa  145  3e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1061 aa  145  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.56 
 
 		 1183 aa  141  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.18 
 
 		 1089 aa  139  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  25.3 
 
 		 1054 aa  140  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 		 1149 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.25 
 
 		 756 aa  139  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 742 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 1165 aa  137  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  24.21 
 
 		 1131 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 		 1162 aa  135  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  24.63 
 
 		 1047 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 1115 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  23.67 
 
 		 1142 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0340  UvrD/REP helicase  25.82 
 
 		 951 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  27.24 
 
 		 739 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 1019 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  25.85 
 
 		 1124 aa  131  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 845 aa  130  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 762 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.03 
 
 		 662 aa  128  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 		 1107 aa  127  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  21.78 
 
 		 1061 aa  127  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  22.59 
 
 		 1166 aa  127  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.28 
 
 		 729 aa  127  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  21.86 
 
 		 1064 aa  126  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 707 aa  125  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 		 741 aa  125  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 741 aa  125  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 		 706 aa  124  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.26 
 
 		 1119 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 730 aa  124  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.09 
 
 		 757 aa  124  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0006  UvrD/REP helicase  25.46 
 
 		 945 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.416534  hitchhiker  0.0000067994 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 730 aa  124  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  24.15 
 
 		 1110 aa  123  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2400  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 		 1194 aa  123  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>