202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0521 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  100 
 
 
1011 aa  1969    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  27.33 
 
 
1029 aa  275  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  26.93 
 
 
1029 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  25.64 
 
 
1020 aa  274  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  26.64 
 
 
1029 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  26.08 
 
 
1018 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  27.09 
 
 
1029 aa  263  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  27.99 
 
 
1018 aa  261  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  27.08 
 
 
1029 aa  261  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  26.59 
 
 
1029 aa  260  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  26.49 
 
 
1029 aa  259  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  25.68 
 
 
1029 aa  259  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  27.22 
 
 
1018 aa  256  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  26.31 
 
 
1029 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  26.31 
 
 
1029 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  26.4 
 
 
1029 aa  253  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  28.46 
 
 
1038 aa  245  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.08 
 
 
1059 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.78 
 
 
1030 aa  226  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  46.77 
 
 
953 aa  174  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  39 
 
 
1018 aa  155  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  22.88 
 
 
906 aa  151  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  32.89 
 
 
1009 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  32.89 
 
 
1009 aa  149  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  41.98 
 
 
1081 aa  149  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  40.7 
 
 
1018 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  38.56 
 
 
1018 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  38.56 
 
 
1018 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  40.85 
 
 
1018 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  27.66 
 
 
1009 aa  143  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  35.11 
 
 
1020 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  25.31 
 
 
1020 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  39.29 
 
 
1018 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  23.38 
 
 
1019 aa  141  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  46.39 
 
 
1018 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  46.39 
 
 
1018 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  46.39 
 
 
1018 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  46.39 
 
 
1018 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  37.1 
 
 
1018 aa  138  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  36.13 
 
 
1039 aa  137  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  37.24 
 
 
1049 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  37.33 
 
 
1013 aa  135  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  44.37 
 
 
1025 aa  135  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  41.52 
 
 
1022 aa  135  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  45.18 
 
 
1017 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  32.5 
 
 
881 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  36.82 
 
 
1018 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  35.92 
 
 
995 aa  132  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  25.81 
 
 
1046 aa  130  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  36.31 
 
 
1046 aa  126  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  37.1 
 
 
1047 aa  124  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  26.4 
 
 
1033 aa  122  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  42.94 
 
 
1024 aa  120  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  21.54 
 
 
1031 aa  118  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  36.92 
 
 
1023 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  42.76 
 
 
995 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  32.49 
 
 
1226 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  34.04 
 
 
1006 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  40.27 
 
 
1291 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  23.77 
 
 
1114 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  35.45 
 
 
986 aa  110  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  25.22 
 
 
1091 aa  109  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  40.88 
 
 
1088 aa  108  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  42.18 
 
 
1219 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  29.3 
 
 
1108 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  30.67 
 
 
986 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  32.43 
 
 
989 aa  106  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  39.89 
 
 
1058 aa  105  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  42.18 
 
 
1230 aa  105  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  38.36 
 
 
1091 aa  105  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  35.33 
 
 
1180 aa  105  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  40.25 
 
 
1346 aa  104  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  40.94 
 
 
1009 aa  104  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  39.33 
 
 
1223 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  39.1 
 
 
1223 aa  103  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  32.84 
 
 
1224 aa  103  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  32.24 
 
 
1165 aa  103  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  36.13 
 
 
962 aa  102  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  29.86 
 
 
1223 aa  101  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  31.69 
 
 
1172 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0673  SMC domain protein  32.62 
 
 
1116 aa  100  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00700495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  32.49 
 
 
910 aa  100  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  39.56 
 
 
1234 aa  99.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  31.15 
 
 
1172 aa  99  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  40 
 
 
1191 aa  99  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  31.88 
 
 
1226 aa  99  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  33.85 
 
 
1214 aa  98.6  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  30.93 
 
 
1214 aa  98.6  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 
1214 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1882  SMC domain protein  30.29 
 
 
904 aa  98.2  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600097  normal  0.549876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  26.63 
 
 
824 aa  97.8  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  27.5 
 
 
810 aa  97.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  33.49 
 
 
1249 aa  97.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  33.85 
 
 
1214 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  32.89 
 
 
1214 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  37.11 
 
 
1214 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  36.09 
 
 
1085 aa  96.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  30.59 
 
 
1232 aa  96.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  32.82 
 
 
1265 aa  95.1  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  24.14 
 
 
1029 aa  94.7  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>